海西蒙古族藏族自治州辖3个县级市、3个县，以及大柴旦行政委员会。
格尔木市辖5个街道、2个镇、2个乡：昆仑路街道、黄河路街道、金峰路街道、河西街道、西藏路街道、郭勒木德镇、唐古拉镇、大格勒乡、乌图美仁乡，以及察尔汗工行委。
德令哈市辖3个街道、3个镇、1个乡：河西街道、河东街道、火车站街道、尕海镇、怀头他拉镇、柯鲁柯镇、蓄集乡。
茫崖市辖3个镇：花土沟镇、茫崖镇、冷湖镇。
乌兰县辖4个镇：希里沟镇、茶卡镇、柯柯镇、铜普镇。
都兰县辖4个镇、4个乡：察汉乌苏镇、香日德镇、夏日哈镇、宗加镇、热水乡、香加乡、沟里乡、巴隆乡。
天峻县辖3个镇、7个乡：新源镇、木里镇、江河镇、快尔玛乡、舟群乡、织合玛乡、苏里乡、生格乡、阳康乡、龙门乡。
大柴旦行政委员会辖2个镇：柴旦镇、锡铁山镇。
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