2006年1月20日，省政府批准同意：撤销佛滩乡，其行政区域并入溪洛渡镇，镇政府驻地不变；撤销黄坪乡，其行政区域并入黄华镇，镇政府驻地不变；撤销万和乡，其行政区域并入莲峰乡，并将莲峰乡改设为莲峰镇，镇政府驻原莲峰乡政府驻地。
至此，永善县辖6个镇、9个乡（其中2个民族乡）：溪洛渡镇、桧溪镇、黄华镇、茂林镇、大兴镇、莲峰镇、团结乡、细沙乡、青胜乡、务基乡、马楠苗族彝族乡、水竹乡、墨翰乡、伍寨彝族苗族乡、码口乡。共有4个居委会、133个行政村。县政府驻溪落渡镇。
【注：以下面积、人口（统计年份不详）数据仅供参考（部分数据待核对）】
永善县 总面积2833平方千米。总人口40.22万人。辖6个镇、7个乡、2个民族乡，4个居委会和133个行政村。
溪洛渡镇 面积343.7平方千米，人口10.20万人，行政区划代码530625101。辖4个居委会和21个行政村。
桧溪镇 面积91.23平方千米，人口1.71万人，行政区划代码530625102。辖6个行政村。
黄华镇 面积209.3平方千米，人口5.50万人，行政区划代码530625103。辖13个行政村。
茂林镇 面积272平方千米，人口2.34万人，行政区划代码530625104。辖7个行政村。
大兴镇 面积146平方千米，人口3.60万人，行政区划代码530625105。辖8个行政村。
莲峰镇 面积291.07平方千米，人口3.59万人，行政区划代码530625106。辖14个行政村。
团结乡 面积197平方千米，人口2.11万人，行政区划代码530625202。辖9个行政村。
细沙乡 面积161.16平方千米，人口1.92万人，行政区划代码530625203。辖7个行政村。
青胜乡 面积92.1平方千米，人口1.11万人，行政区划代码530625204。辖4个行政村。
务基乡 面积135.4平方千米，人口3.03万人，行政区划代码530625205。辖8个行政村。
马楠苗族彝族乡 面积190.34平方千米，人口1.28万人，行政区划代码530625207。辖6个行政村。
水竹乡 面积175.8平方千米，人口0.94万人，行政区划代码530625208。辖5个行政村。
墨翰乡 面积161平方千米，人口2.42万人，行政区划代码530625211。辖10个行政村。
伍寨彝族苗族乡 面积174.2平方千米，人口1.14万人，行政区划代码530625212。辖5个行政村。
码口乡 面积149平方千米，人口3.00万人，行政区划代码530625213。辖10个行政村。