1949年12月17日新疆省人民政府成立，省人民政府驻迪化市。辖迪化市及迪化、昌吉、乾德、景化、吐鲁番、绥来、阜康、孚远、奇台、鄯善、托克逊、木垒河、伊宁、绥定、宁西、霍尔果斯、昭苏、博乐、温泉、特克斯、巩哈、精河、疏附、疏勒、伽师、巩留、巴楚、英吉沙、蒲犁、乌恰、阿图什、岳普湖、阿克苏、温宿、拜城、库车、沙雅、乌什、阿瓦提、柯坪、新和、阿合奇、塔城、额敏、沙湾、乌苏、和丰、裕民、承化、福海、青河、哈巴河、吉木乃、富蕴、布尔津、和阗、墨玉、策勒、于阗、洛浦、皮山、焉耆、和靖、轮台、尉犁、婼羌、且末、库尔勒、哈密、镇西、伊吾、莎车、泽普、叶城、麦盖提、民丰、新源、和硕等78县和七角井中心区。
1950年新疆省由西北军政委员会领导。全省分设迪化、伊犁、塔城、阿山、哈密、焉耆、和阗、莎车、喀什、阿克苏等10专区。
1952年新疆省由西北行政委员会领导。
1953年原迪化市改称乌鲁木齐市。
1954年新疆省改由中央直接领导。迪化专区改称乌鲁木齐专区；阿山专区改称阿勒泰专区；焉耆专区改称库尔勒专区。设立克孜勒苏柯尔克孜族自治区、昌吉回族自治区、博尔塔拉蒙古族自治区、巴音郭楞蒙古族自治区；并设立南疆行政区，行署驻喀什市，辖喀什、和阗、莎车、阿克苏4专区和克孜勒苏柯尔克孜族自治区。1954年11月29日设立伊犁哈萨克族自治州，伊宁市改为伊犁哈萨克族自治州辖市，伊犁哈萨克族自治州辖伊犁、塔城、阿勒泰3专区；博尔塔拉蒙古族自治区由省委托伊犁哈萨克族自治州代管。
1955年9月13日第一届全国人民代表大会常务委员会第21次会议通过“关于成立新疆维吾尔自治区撤销新疆省建制的决议”，新疆省于1955年10月1日正式撤销并改设为新疆维吾尔自治区。自治区人民委员会驻乌鲁木齐市。撤销喀什、伊犁2专区，原喀什专区各县由南疆行署直接领导；原伊犁专区各县由伊犁哈萨克族自治州直接领导。
1956年撤销南疆行政区，恢复喀什专区。喀什市和原由南疆行署直辖的疏附、疏勒、伽师、岳普湖、巴楚、英吉沙等6县和塔什库尔干塔吉克族自治县，划归喀什专署领导；原属行署领导的阿克苏、和阗2专区和克孜勒苏柯尔克孜自治州，由自治区直接领导。撤销莎车专区，并入喀什专区。
1958年撤销乌鲁木齐专区，将吐鲁番、托克逊、鄯善3县改由自治区直辖；其余各县划归昌吉回族自治州。设立克拉玛依市，由自治区直辖。
1959年和阗专区改名为和田专区。
1960年撤销库尔勒专区，并入巴音郭楞蒙古自治州。
1970年原哈密、和田、阿克苏、喀什、塔城、阿勒泰等6专区分别改为地区。原由自治区直辖的吐鲁番、托克逊2县划归乌鲁木齐市领导；鄯善县划归哈密地区领导。
1975年以克拉玛依市部分地区设立奎屯市，由伊犁哈萨克自治州领导。伊犁哈萨克自治州驻地由伊宁市迁奎屯市。设立伊犁地区，地区驻伊宁市。原直属伊犁哈萨克自治州领导的伊宁市和伊宁、尼勒克、新源、巩留、特克斯、昭苏、霍城等7县和察布查尔锡伯自治县划归伊犁地区领导。设立吐鲁番地区及石河子地区。
1978年撤销石河子地区；原由石河子地区领导的石河子市改由自治区直辖。
1979年撤销伊犁地区，原属伊犁地区的市、县和自治县由伊犁哈萨克自治州直接领导。新疆维吾尔自治区直辖乌鲁木齐、克拉玛依、石河子3市，分设吐鲁番、哈密、和田、阿克苏、喀什、塔城、阿勒泰7地区和巴音郭楞蒙古自治州、克孜勒苏柯尔克孜自治州、昌吉回族自治州、博尔塔拉蒙古自治州和伊犁哈萨克自治州等5自治州。共辖8市（包括自治区辖市3、地辖市5）、74县、6自治县。
1. 乌鲁木齐市
迪化市、乌鲁木齐市 1949年迪化市为新疆省辖市，新疆省人民政府驻地。
1953年原迪化市改称乌鲁木齐市，仍由省直辖。
1955年新疆维吾尔自治区成立，乌鲁木齐市为新疆维吾尔自治区政府驻地。
1959年原属昌吉回族自治州的乌鲁木齐县（驻乌鲁木齐市）划归乌鲁木齐市领导。
1970年原由自治区直辖的吐鲁番、托克逊2县划归乌鲁木齐市领导。
1975年将吐鲁番、托克逊2县划归吐鲁番地区。
〔迪化专区、乌鲁木齐专区〕 1950年设迪化专区，专署驻迪化市。辖迪化、绥来、景化、昌吉、乾德、阜康、孚远、奇台、木垒河、鄯善、吐鲁番、托克逊等12县。
1953年原迪化市改为乌鲁木齐市，原迪化县改称乌鲁木齐县，原乾德县改称米泉县，原绥来县改称玛纳斯县，原景化县改称呼图壁县，原孚远县改称吉木萨尔县。
1954年迪化专区改称乌鲁木齐专区，专署驻乌鲁木齐市。1954年7月15日木垒河县改设木垒哈萨克族自治区。将乌鲁木齐、昌吉、米泉3县划归昌吉回族自治区。乌鲁木齐专区辖玛纳斯、呼图壁、阜康、吉木萨尔、奇台、鄯善、吐鲁番、托克逊8县和木垒哈萨克族自治区。
1955年木垒哈萨克族自治区改设木垒哈萨克族自治县。
1958年撤销乌鲁木齐专区，将吐鲁番、托克逊、鄯善3县改由自治区直辖；玛纳斯、呼图壁、奇台、阜康、吉木萨尔5县和木垒哈萨克族自治县划归昌吉回族自治州。
2. 克拉玛依市
克拉玛依市 1958年以克拉玛依、独山子等地区设立克拉玛依市，由自治区直辖。
3. 石河子市
石河子市 1976年以原沙湾县的石河子镇和沙湾部分地区设立石河子市，属石河子地区领导。
1978年石河子市改由自治区直辖。
〔石河子地区〕 1976年设立石河子地区，地区驻石河子市。将新设的石河子市和原属塔城地区的沙湾县（驻三道河子）、原属昌吉回族自治州的玛纳斯县划归石河子地区。
1978年撤销石河子地区，石河子市改由自治区直辖，将沙湾县划归塔城地区，玛纳斯县划归昌吉回族自治州。
4. 吐鲁番地区
吐鲁番地区 1975年设立吐鲁番地区，地区驻吐鲁番县。原属乌鲁木齐市领导的吐鲁番、托克逊2县和哈密地区的鄯善县划归吐鲁番地区。辖3县。
5. 哈密地区
哈密专区、哈密地区 1950年设哈密专区，专署驻哈密县。辖哈密、镇西、伊吾3县和七角井中心区。
1953年原镇西县改称巴里坤县。
1954年9月30日巴里坤县改称巴里坤哈萨克族自治区。撤销七角井中心区，改设为七角井镇（乡级镇），由哈密县领导。哈密专区辖2县、1自治区。
1955年巴里坤哈萨克族自治区改设巴里坤哈萨克族自治县。哈密专区辖2县、1自治县。
1961年以原哈密县城镇为基础设立哈密市，由哈密专署领导。
1962年撤销哈密市，并入哈密县。
1970年哈密专区改称哈密地区，地区驻哈密县。辖哈密、伊吾2县和巴里坤哈萨克自治县。
1971年原由自治区直辖的鄯善县划入哈密地区。辖3县、1自治县。
1975年将鄯善县划归吐鲁番地区。
1977年复设哈密市，由哈密地区领导。哈密地区辖1市、2县、1自治县。
6. 巴音郭楞蒙古自治州
巴音郭楞蒙古自治区、巴音郭楞蒙古自治州 1954年6月23日设立巴音郭楞蒙古自治区，自治区人民政府驻焉耆回族自治区。原属焉耆专区的和靖、和硕2县和焉耆回族自治区（原焉耆县改设）划归巴音郭楞蒙古自治区。
1955年巴音郭楞蒙古自治区改设巴音郭楞蒙古自治州，自治州人民委员会驻焉耆回族自治县。原焉耆回族自治区改设焉耆回族自治县。辖2县、1自治县。
1960年原库尔勒专区所属库尔勒、且末、尉犁、轮台、若羌等5县划入巴音郭楞蒙古自治州。辖7县、1自治县。
1965年和靖县改为和静县。
1970年由和硕、焉耆2县析置博湖县（驻包拉苏木）。巴音郭楞蒙古自治州辖8县、1自治县。
1979年由原库尔勒、焉耆2县析置库尔勒市，属巴音郭楞蒙古自治州领导。辖1市、8县、1自治县。
〔焉耆专区、库尔勒专区〕 1950年设焉耆专区，专署驻焉耆县，辖焉耆、库尔勒、轮台、和靖、和硕（驻清水河子）、尉犁、婼羌、且末等8县。
1954年焉耆专署迁驻库尔勒县，改称库尔勒专区。1954年3月15日焉耆县改设焉耆回族自治区。将和靖、和硕2县和焉耆回族自治区划归巴音郭楞蒙古自治区。库尔勒专区辖库尔勒、婼羌、且末、尉犁、轮台5县。
1959年婼羌县改名为若羌县。
1960年撤销库尔勒专区，原库尔勒专区所属库尔勒、尉犁、若羌、且末、轮台5县划归巴音郭楞蒙古自治州。
7. 和田地区
和阗专区、和田专区、和田地区 1950年设和阗专区，专署驻和阗县。辖和阗、墨玉、皮山、洛浦、策勒、于阗、民丰（哈力拜也提）等7县。
1959年和阗专区改名为和田专区，和阗县改名为和田县，于阗县改名为于田县。
1970年和田专区改称和田地区，地区驻和田县。辖和田、洛浦、民丰、皮山、策勒、墨玉、于田等7县。
8. 阿克苏地区
阿克苏专区、阿克苏地区 1950年设阿克苏专区，专署驻阿克苏县。辖阿克苏、温宿、拜城、库车、新和、沙雅、阿瓦提、柯坪、阿合奇、乌什等10县。
1954年将阿合奇县划归克孜勒苏柯尔克孜自治区。阿克苏专区辖9县。
1958年撤销温宿县，并入阿克苏县。阿克苏专区辖8县。
1962年恢复温宿县。阿克苏专区辖9县。
1970年阿克苏专区改称阿克苏地区，地区驻阿克苏县。辖阿克苏、温宿、拜城、库车、新和、沙雅、阿瓦提、柯坪、乌什等9县。
9. 喀什地区
喀什专区、喀什地区 1950年设喀什专区，专署驻疏附县。辖疏附（驻喀什）、疏勒、阿图什、伽师、岳普湖、巴楚、英吉沙、蒲犁、乌恰等9县。
1952年由疏附县析置喀什市，由喀什专署领导。喀什专署驻喀什市。辖1市、9县。
1954年将阿图什、乌恰2县划归克孜勒苏柯尔克孜自治区。1954年9月17日蒲犁县改设塔什库尔干塔吉克族自治区。喀什专区辖1市、6县、1自治区。
1955年塔什库尔干塔吉克族自治区改设塔什库尔干塔吉克族自治县。疏附县迁驻托库扎克巴扎。后撤销喀什专区，将疏附、疏勒、伽师、岳普湖、巴楚、英吉沙6县和塔什库尔干塔吉克族自治县改由南疆行署直辖。
1956年撤销南疆行署，恢复喀什专区，专署驻喀什市。将喀什市和原由南疆行署直辖的疏附、疏勒、伽师、岳普湖、巴楚、英吉沙6县及塔什库尔干塔吉克族自治县，原莎车专区所属麦盖提、莎车、泽普、叶城4县划归喀什专区。辖1市、10县、1自治县。
1970年喀什专区改称喀什地区，地区驻喀什市。辖喀什市及巴楚、伽师、岳普湖、麦盖提、莎车、泽普、叶城、疏勒、英吉沙、疏附等10县及塔什库尔干塔吉克自治县。
〔莎车专区〕 1950年设莎车专区，专署驻莎车县。辖莎车、麦盖提、泽普、叶城等4县。
1956年撤销莎车专区，原莎车专区所属莎车、麦盖提、泽普、叶城4县划归喀什专区。
10. 克孜勒苏柯尔克孜自治州
克孜勒苏柯尔克孜自治区、克孜勒苏柯尔克孜自治州 1954年7月14日设立克孜勒苏柯尔克孜族自治区，自治区人民政府驻阿图什县。将原属喀什专区的阿图什、乌恰2县和原属阿克苏专区的阿合奇县划归克孜勒苏柯尔克孜自治区。辖3县。
1955年原克孜勒苏柯尔克孜族自治区改设克孜勒苏柯尔克孜自治州，自治州人民委员会驻阿图什县。由塔什库尔干塔吉克族自治县的一部及英吉沙、疏附、乌恰3县各一部分地区合并设置阿克陶县。辖阿图什、阿合奇、阿克陶、乌恰4县。
11. 昌吉回族自治州
昌吉回族自治区、昌吉回族自治州 1954年7月15日设立昌吉回族自治区，自治区人民政府驻昌吉县。原属乌鲁木齐专区的乌鲁木齐、昌吉、米泉3县划归昌吉回族自治区。
1955年原昌吉回族自治区改设昌吉回族自治州，自治州人民委员会驻昌吉县，辖昌吉、米泉、乌鲁木齐3县。
1958年原乌鲁木齐专区所属玛纳斯、呼图壁、奇台、阜康、吉木萨尔5县和木垒哈萨克族自治县划入昌吉回族自治州。辖8县、1自治县。
1959年将乌鲁木齐县划归乌鲁木齐市领导。
1976年将玛纳斯县划归石河子地区。
1978年原石河子地区所属玛纳斯县划入昌吉回族自治州。辖7县、1自治县。
12. 博尔塔拉蒙古自治州
博尔塔拉蒙古自治区、博尔塔拉蒙古自治州 1954年7月13日设立博尔塔拉蒙古自治区，自治区人民政府驻博乐县，原属伊犁专区的博乐、温泉、精河3县划归博尔塔拉蒙古自治区。
1955年原博尔塔拉蒙古自治区改设博尔塔拉蒙古自治州，自治州人民委员会驻博乐县，辖博乐、温泉、精河3县。
13. 伊犁地区
伊犁专区、伊犁地区 1950年设伊犁专区，专署驻伊宁县。辖伊宁（驻宁远）、绥定、霍城、温泉、博乐、精河、巩哈、新源、巩留、特克斯、昭苏、伊宁等12县。
1952年由伊宁县析置伊宁市，属伊犁专署领导。伊犁专署驻伊宁市。辖1市、12县。
1953年巩哈县改名为倪利克县。
1954年原倪利克县改名为尼勒克县。1954年3月25日宁西县改称察布查尔锡伯族自治区。将温泉、博乐、精河3县划归博尔塔拉蒙古自治区。1954年11月29日伊犁哈萨克族自治州成立后，伊犁专区属伊犁哈萨克族自治州领导。
1955年撤销伊犁专区，原伊犁专区所属伊宁、绥定、霍城、新源、巩留、尼勒克、特克斯、昭苏等8县和察布查尔锡伯族自治县（原察布查尔锡伯族自治区改设）改由伊犁哈萨克族自治州直辖。
1957年伊宁县驻地迁吉里圩孜。
1965年绥定县改名为水定县。
1966年撤销水定县，并入霍城县。霍城县迁驻水定镇。
1975年设立伊犁地区，属伊犁哈萨克自治州领导。伊犁地区驻伊宁市。原由伊犁哈萨克自治州直辖的伊宁市和伊宁（驻吉里圩孜）、尼勒克、新源、巩留、特克斯、昭苏、霍城（驻水定）等7县和察布查尔锡伯自治县划归伊犁地区。辖1市、7县、1自治县。
1979年撤销伊犁地区，原属伊犁地区的伊宁市及伊宁、尼勒克、新源、巩留、特克斯、昭苏、霍城等7县及察布查尔锡伯自治县由伊犁哈萨克自治州直接领导。
14. 塔城地区
塔城专区、塔城地区 1950年设塔城专区，专署驻塔城县。辖塔城、裕民、额敏、和丰、沙湾、乌苏等6县。
1951年由额敏县析置托里中心区。
1952年托里中心区改设托里县。塔城专区辖7县。
1954年9月10日和丰县改设和布克赛尔蒙古自治区。
1955年和布克赛尔蒙古自治区改设和布克赛尔蒙古自治县。塔城专区辖6县、1自治县。
1957年沙湾县驻地迁三道河子。
1970年塔城专区改称塔城地区，地区驻塔城县。辖塔城、乌苏、托里、裕民（驻哈拉布拉）、额敏、沙湾（驻三道河子）等6县及和布克赛尔蒙古自治县。
1976年将沙湾县划归石河子地区。塔城专区辖5县、1自治县。
1978年原石河子地区所属沙湾县划入塔城地区。辖6县、1自治县。
15. 阿勒泰地区
阿山专区、阿勒泰专区、阿勒泰地区 1950年设阿山专区，专署驻承化县。辖承化、富蕴、青河、福海、布尔津、哈巴河、吉木乃等7县。
1953年原承化县改称阿泰县。
1954年阿泰县改称阿勒泰县。原阿山专区改称阿勒泰专区，专署驻阿勒泰县。辖阿勒泰、青河、富蕴、福海、吉木乃、布尔津、哈巴河等7县。
1970年阿勒泰专区改称阿勒泰地区，地区驻阿勒泰县。辖阿勒泰、青河、富蕴、福海、吉木乃、布尔津、哈巴河等7县。
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