2006年，撤销南雅乡，其行政区域并入娜允镇，镇政府驻地不变。
调整后，全县辖3个镇、3个乡：娜允镇、勐马镇、芒信镇、景信乡、富岩乡、公信乡，以及勐连农场。共有3个居委会、39个行政村。县政府驻娜允镇。
【注：以下面积、人口（统计年份不详）数据仅供参考（部分数据待核对）；沿革根据《中国政区大典》（部分根据其他资料加以修改）】
全县总面积1957平方千米，总人口13.29万人。辖3个镇、3个乡，3个居委会、39个行政村。县政府驻娜允镇。
娜允镇 [面积]359.28平方千米 [人口]4.72万人 [邮编]665800 [代码]530827101
辖3个居委会、9个行政村：城东、古城、金塔；娜允、芒掌、芒弄、景吭、芒街、南雅、允山、洪安、南抗。镇政府驻娜允。
“娜允”是傣语谐音，为“内城”之意。1289年（傣历651年）傣王罕罢法在孟连建傣城——娜允，元朝朝廷在此设“木连路军民府”。明永乐四年（1406），明朝设“孟连长官司”，隶云南都司。1949年前直属孟连宣抚司署管辖，1950年为澜沧县的孟连区一村、二村，1954年为孟连区，1958年改乡，1969年改公社，1984年改区，1988年改孟连镇。2001年更名为娜允镇。原南雅乡1950年为孟连区第四村，1954年为孟连区南抗、允山乡。1958年合并为南抗乡（区级），1960年成立南雅区，1969改公社，1984年改区，1988年置乡。2006年，撤销南雅乡，其行政区域并入娜允镇。
勐马镇 [面积]515.05平方千米 [人口]2.72万人 [邮编]665801 [代码]530827102
辖8个行政村：勐马、帕亮、芒海、贺安、勐阿、双相、腊福、东乃。镇政府驻小寨。
勐马镇以驻地得名，勐马是傣语地名，“勐”为地方，“马”为来到之意。“勐马”即从其它地方迁来居住的村庄。1949年前属孟连宣抚司召根达管辖，1950年为澜沧县南卡区，1954年6月16日成立孟连傣族拉祜族佤族自治区人民政府后改为勐马区，1969年改为勐马公社，1984年改为勐马区，1988年2月改为勐马镇。
芒信镇 [面积]340.76平方千米 [人口]1.52万人 [邮编]665808 [代码]530827103
辖6个行政村：芒信、拉戛、芒卡、海东、岔河、班顺。镇政府驻芒信。
1950年为孟连区海东、芒京村，1954年成立腊垒区，1969年改公社，1984年改区，1988年置腊垒乡。2002年，正式撤乡设镇，并更名为芒信镇。
景信乡 [面积]169.88平方千米 [人口]1.35万人 [邮编]665807 [代码]530827201
辖5个行政村：回俄、景冒、朗勒、勐白、糯各。乡政府驻回俄。
1950年为孟连区第三村。1954年为孟连区独固、朗勒乡。1958年合并为独固乡（区级）。1960立成立景信区，1969年改公社，1984年改区，1988年置乡。
富岩乡 [面积]239.26平方千米 [人口]1.33万人 [邮编]665805 [代码]530827203
全乡辖5个行政村：信岗、英沟、大曼糯、等戛拉、芒冒。乡政府驻富岩。
1950年为孟连区第七村，1954年设富岩区，1969年改公社，1984年改区，1988年置乡。
公信乡 [面积]269.19平方千米 [人口]1.41万人 [邮编]665804 [代码]530827204
全乡辖6个行政村：班别、公良、公信、糯董、广科、班文。乡政府驻班别上寨。
1950年为南卡区公信村，1954年为勐马区第二村，1955年为勐马区公信、糯董乡，1960年两乡合并成立公信区，1969年改公社，1984年改区，1988年置乡。
孟连农场 [邮编]665802 [代码]530827401
孟连农场属云南农垦集团普洱农垦分局。农场总人口4267人。