2006年1月20日，省政府批准同意撤销中和乡及古城镇，其行政区域并入昆阳镇，镇政府驻原中和乡政府驻地；撤销化乐乡，其行政区域并入晋城镇，晋城镇政府驻地不变。
乡（镇）撤并后部份乡（镇）行政区域界线发生变化如下：
1、乡（镇）行政区域界线废止有3条：（1）2001年4月5日签订的《古城镇人民政府与中和乡人民政府联合勘定的行政区域界线》废止；（2）1999年8月5日签订的《昆阳镇人民政府与中和乡人民政府联合勘定的行政区域界线》废止；（3）2001年5月28日签订的《晋城镇人民政府与化乐乡人民政府联合勘定的行政区域界线》废止。
2、乡（镇）行政区域界线三交点废止有2个：（1）2001年5月28日签订的《二街、古城、中和三乡（镇） 行政区域界线三交点》废止；（2）1999年12月29日签订的《上蒜、晋城、化乐三乡（镇）行政区域界线三交点》废止。
3、乡（镇）行政区域界线三交点变更有3 个：（1）原中和乡与二街乡、宝峰镇三交点变更为昆阳镇与二街乡、宝峰镇行政区域界线三交点；（2）原中和乡与宝峰镇、上蒜乡三交点变更为昆阳镇与宝峰镇、上蒜乡行政区域界线三交点；（3）原化乐乡与上蒜乡、六街乡三交点变更为晋城镇与上蒜乡、六街乡行政区域界线三交点。
4、乡（镇）行政区域界线变更有6条：（1）原古城镇与二街乡行政区域界线变更为昆阳镇与二街乡行政区域界线；（2）原中和乡与二街乡行政区域界线变更为昆阳镇与二街乡行政区域界线；（3）原中和乡与宝峰镇行政区域界线变更为昆阳镇与宝峰镇行政区域界线；（4）原中和乡与上蒜乡行政区域界线变更为昆阳镇与上蒜乡行政区域界线；（5）原化乐乡与六街乡行政区域界线变更为晋城镇与六街乡行政区域界线；（6）原化乐乡与上蒜乡行政区域界线变更为晋城镇与上蒜乡行政区域界线。
5、乡（镇）行政区域界线、三交点继续有效的有2条线、1个三交点：（1）1999年8月5日《新街乡人民政府与晋城镇人民政府联合勘定的行政区域界线协议书》继续有效；（2）2001年12月10日《晋城镇人民政府与上蒜乡人民政府联合勘定的行政区域界线协议书》继续有效。（3）1999年7月14日勘定的上蒜、新街、晋城三乡（镇）行政区域界线三交点继续有效。
2001年前已勘定的乡（镇）行政区域界线，飞在对方界线内的飞山、飞林、零星田、地管理使用权不变，继续有效。
【注：以下面积、人口（统计年份不详）数据仅供参考（部分数据待核对）】
晋宁县 总面积1391平方千米，人口28.02万人。辖3个镇、6个乡（其中2个民族乡）：昆阳镇、晋城镇、宝峰镇、二街乡、新街乡、双河彝族乡、夕阳彝族乡、上蒜乡、六街乡。共有4个居委会、129个行政村。县政府驻昆阳镇。
昆阳镇 [面积]119.79平方千米 [人口]8.35万人 [邮编]650600 [代码]530122101
辖2个居委会、25个行政村：郑和路、月山；仁义、礼智、恢厂、汉营、甸心、旧寨、中宜、下方古城、 田心、太史、兴隆、大新、堡孜、储英、墩子、兴旺、渠东、凤踪、普达、南村、安企、回龙、瓦窑、乌龙、余家海。镇政府驻中河路。
晋城镇 [面积]219.81平方千米 [人口]5.60万人 [邮编]650605 [代码]530122103
辖2个居委会、24个行政村：城北、城南；北门、西门、南门、东门、草村、小海、永和、柴河、天城门、新庄、小寨、石碑、五里、富有、广济、白沙、雨孜雾、化乐、关岭、火石坡、八家、南山、盐井、十里。镇政府驻庄趫路。
宝峰镇 [面积]151.73平方千米 [人口]1.64万人 [邮编]650601 [代码]530122104
辖13个行政村：上方新街、青龙、宝峰、前卫、挖矿坡、上方古城、小河口、韩家营、中和铺、昌家营、清水河、海龙、酸水塘。镇政府驻上方新街。
二街乡 [面积]163.48平方千米 [人口]1.54万人 [邮编]650608 [代码]530122201
辖9个行政村：肖家营、朱家营、锁溪渡、老高、鲁黑、甸头、三家、栗庙、响水。乡政府驻二街。
新街乡 [面积]31.67平方千米 [人口]3.52万人 [邮编]650606 [代码]530122203
辖18个行政村：新街、文河、回龙、三合、古城、安江、安乐、沙堤、团山、三槐、梁王、海晏、孙家坝、宋家营、钟贵、大西、福安、石龙。乡政府驻新街。
双河彝族乡 [面积]152.03平方千米 [人口]0.91万人 [邮编]650602 [代码]530122204
辖6个行政村：双河、田坝、荒川、干河、老江河、核桃园。乡政府驻双河街。
夕阳彝族乡 [面积]156.51平方千米 [人口]1.01万人 [邮编]650603 [代码]530122205
辖10个行政村：夕阳、保安、田房、新山、打黑、一字格、绿溪、木杵榔、木鮓、高梁地。乡政府驻夕阳街。
上蒜乡 [面积]127.26平方千米 [人口]3.45万人 [邮编]650607 [代码]530122206
辖15个行政村：下石美、石寨、河泊、金沙、牛恋、小朴、宝兴、竹园、上蒜、三多、柳坝、科地、段七、洗澡塘、鲁纳。乡政府驻石将军街。
六街乡 [面积]108.58平方千米 [人口]1.26万人 [邮编]650609 [代码]530122207
辖9个行政村：六街、大营、龙王塘、三印、大庄、新寨、干海、青菜、王家湾。乡政府驻六街。