金华市域春秋时属越国。秦、汉为乌伤县，属会稽郡。东汉初平三年（192）置长山县，是为金华建县之始。三国吴宝鼎元年（266）置郡名东阳，以郡在瀫水（即衢江）之东、长山之阳得名。金华设立郡府建置自此始。隋开皇十八年（598）始名金华县。
2000年6月30日，浙政发[2000]135号批复同意撤销孝顺镇、鞋塘镇建制，合并设立新的孝顺镇，辖115行政村、1居民区，驻后项行政村。调整后，金华县辖15个镇、8个乡。
2000年第五次人口普查，金华县总人口475800人。其中：孝顺镇59846人，傅村镇21086人，曹宅镇37908人，塘雅镇24485人，澧浦镇29710人，岭下镇13161人，江东镇10305人，雅畈镇18959人，安地镇10846人，白龙桥镇53779人，琅琊镇15942人，蒋堂镇28100人，汤溪镇39587人，罗埠镇29959人，洋埠镇12786人，源东乡14032人，赤松乡12102人，长山乡11106人，箬阳乡3184人，沙畈乡11218人，塔石乡7899人，岭上乡5385人，莘畈乡4415人。
2000年12月30日，国务院批准（国务院国函[2000]138号）撤销金华县，设立金华市金东区。以原金华县的傅村、孝顺、曹宅、塘雅、澧浦、岭下、江东、赤松、源东和金华市婺城区的仙桥、多湖、东孝12个乡（镇）为金东区的行政区域。区政府驻多湖镇。将原金华县的雅畈、安地、白龙桥、琅琊、蒋堂、汤溪、罗埠、洋埠、长山、沙畈、塔石、岭上、莘畈、箬阳14个乡（镇）划归婺城区管辖。2001年，浙政发[2001]1号文件批复同意撤销金华县，设立金华市金东区。辖9镇3乡，510个行政村。
2002年7月31日，根据《浙江省人民政府关于金华市婺城区、金东区部分行政区划调整的批复》（浙政函[2002]116号）精神，金东区部分行政区划调整如下：（1）撤销金东区多湖镇、东孝乡建制，设立多湖、东孝街道办事处，两个街道办事处由金东区人民政府直辖。多湖街道办事处管辖原多湖镇管辖的七里畈、新屋、厅上、东盛、西盛、樟新、牛皮塘、下渎口、大项、永红、十二里、新安、上古井、望府墩、庄头、王坦、泉源、驿头、横塘沿、叶宅、林头、黄泥山、近宅、潭头滩、毛草山、潭头、汀村、里秧田、雅地、杨宅、东龙口、社坛头、缸窑、王宅埠、孟宅35个行政村，街道办事处驻环城东路；东孝街道办事处管辖原东孝乡管辖的戴店、前田、施村、黄沙塘、毛竹园、湖菱桥、麻车塘、叶明、杨溪、雅方埠、东藕塘、楼店、凤凰庵、下王、东关、金东、山垄头、经堂头、王牌、下于、陶朱路、桥头22个行政村，街道办事处驻金瓯路。（2）撤销金东区仙桥镇、赤松乡建制，合并设立赤松镇，由金东区人民政府直辖。新组建的赤松镇管辖原仙桥镇、赤松乡管辖的仙桥、桥东、石牌、西前路、下陈、棉塘、高塘村、月塘、官沿头、下新屋、下钱村、洪村桥、上钱村、郭村、下潘村、岩塘、下塔山、潘村、中联、下牌塘、尘不染、新屋头、黄泥垄、双塘、下杨、桥里方、石桥、大源、上汪、西余、北山口、上项村、石下、岗上、石耕背、东塘、王宅、山口冯、钟头、双门40个行政村，镇政府驻仙桥行政村。行政区划调整后，金东区辖8个镇，1个乡，2个街道办事处。
2002年，金东区辖2个街道、8个镇、1个乡：多湖街道、东孝街道、孝顺镇、傅村镇、曹宅镇、澧浦镇、岭下镇、江东镇、塘雅镇、赤松镇、源东乡，共有511个行政村。区政府暂驻东孝街道金瓯路381号。
2003年末，金东区总人口298319人。辖2个街道、8个镇、1个乡，511个行政村。多湖街道面积32.7平方千米，人口20912人，辖35个行政村。东孝街道面积24.0平方千米，人口15499人，辖22个行政村；赤松镇面积56.0平方千米，人口28469人，辖40个行政村；合计面积112.7平方千米，人口64880人，辖97个行政村。孝顺镇面积130.0平方千米，人口63330人，辖115个行政村；傅村镇面积35.0平方千米，人口23339人，辖35个行政村；合计面积165平方千米，人口86669人，辖150个行政村。曹宅镇面积93.0平方千米，人口40923人，辖67个行政村。塘雅镇面积53.0平方千米，人口28755人，辖48个行政村。澧浦镇面积98.5平方千米，人口34171人，辖63个行政村。岭下镇面积58.0平方千米，人口15191人，辖34个行政村。江东镇面积34.0平方千米，人口11406人，辖24个行政村。源东乡面积47.6平方千米，人口16324人，辖27个行政村。（数据来源于金东区政府网站）
2004年，撤销多湖街道七里贩、望府墩、叶宅、林头、横塘沿，东孝街道王牌、戴店、下王等8个村，分别设立社区。2004年末，金东区辖2个街道、8个镇、1个乡，13个社区、493个行政村，面积656平方千米，人口密度457人/平方千米。
2011年，全区总面积657平方千米。总人口31万人。辖2个街道、8个镇、1个乡：多湖街道、东孝街道、孝顺镇、傅村镇、曹宅镇、澧浦镇、岭下镇、江东镇、塘雅镇、赤松镇、源东乡。区政府驻多湖街道光南路836号。