1961年6月，撤销18个公社，全县划为6个区，成立区人民政府，即鲁史区、猛佑区、马街区、凤山区、雪山区、营盘区，同时凤山镇升格为区级单位，称凤山镇人民政府。1962年7月，增设大寺、洛党、郭大寨、诗礼四个区。1962年11月，将全县十个区人民政府改为十个区公所，凤山镇人民政府不变，下辖124个小公社。1967年3月，实行军管后，各区、镇成立革命领导小组。1968年1月26日，县军管会决定：将大寺区改为江河区，马街区改为春江区、郭大寨区改为琼英区，鲁史区改为汇江区。1968年4月后，各区先后成立了革命委员会。
1969年5月22日，省革委通知将区改为公社，汇江区改为汇江公社、猛佑区改为红旗公社、江河区改为前进公社、春江区改为春江公社，洛党区改为东风公社、营盘区改为五七公社、琼英区改为东方红公社、凤山区改为凤山公社、雪山区改为雪山公社。1972年12月，设立永新公社（从鲁史划出）、三岔河公社（从营盘、郭大寨、雪山划出）。1973年1月，设立腰街公社（从马街划出），德思理公社（从猛佑划出）。至此，全县共有15个公社、1个镇、216个生产大队，4个街道居民委员会。1979年7月后，全县15个公社取消革委会名称，改称公社管理委员会（简称公社管委会）。
1984年3月，进行区乡体制改革，取消公社管委会名称，实行党政分设，成立区公所。大队管委调整为乡人民政府，为一级基层政权机构。通过体制改革后，全县共设15个区公所，一个镇人民政府，185个乡（镇）人民政府，4个街道办事处的行政规模。1988年2月，全县开展撤区建乡，设12个乡（其中7个民族乡），即诗礼乡、大寺乡、猛佑乡、三岔河乡、雪山乡、新华彝族苗族乡、永新彝族乡、马街彝族乡、腰街彝族乡、洛党彝族乡、德思里彝族乡、郭大寨彝族白族乡；3个镇，即凤山镇、鲁史镇、营盘镇。下辖138个村公所，51个办事处（其中4个街道办事处）。
1993年3月11日，经省民政厅批准，撤销马街彝族乡，建立小湾镇，下属12个村公所改为办事处。1996年，凤庆县辖4个镇、11个乡（含6个民族乡）：凤山镇、鲁史镇、营盘镇、小湾镇、诗礼乡、新华彝族苗族乡、永新彝族乡、大寺乡、腰街彝族乡、洛党彝族乡、勐佑乡、德思里彝族佤族乡、三岔河乡、雪山乡、郭大寨彝族白族乡。县政府驻凤山镇。
2000年第五次人口普查，凤庆县常住总人口426943人，其中：凤山镇69809人，鲁史镇20354人，小湾镇28947人，营盘镇41642人，诗礼乡24605人，新华乡26841人，永新乡9296人，大寺乡37051人，勐佑乡36672人，德思里乡11162人，腰街乡8535人，洛党乡36021人，雪山乡28535人，三岔河乡26540人，郭大寨乡20933人。
2000年10月，开展村级体制改革，改126个村公所、63个办事处为185个村民委员会和4个街道办事处。2001年，全县辖4个镇、5个乡、6个民族乡：凤山镇、鲁史镇、营盘镇、小湾镇、勐佑乡、雪山乡、三岔河乡、洛党彝族镇、诗礼乡、大寺乡、新华彝族苗族乡、永新彝族乡、德思里彝族佤族乡、腰街彝族乡、郭大寨彝族白族乡。
2002年，三岔河乡、勐佑乡、雪山乡撤乡设镇（省政府2002年3月19日批准）；洛党彝族乡撤乡设镇（省政府2002年4月3日批准）。2002年底，全县共有8个镇，7个乡；下辖185个村委会和4个居委会。
2005年，撤销永新彝族乡，其行政区域并入鲁史镇，鲁史镇政府驻地不变；撤销德思里彝族佤族乡，其行政区域并入勐佑镇，勐佑镇政府驻地不变（省政府2005年8月16日批准）。
2006年，凤庆县总面积3451平方千米。总人口44.92万人。辖8个镇、5个乡（其中3个民族乡）：凤山镇、鲁史镇、小湾镇、营盘镇、三岔河镇、勐佑镇、雪山镇、洛党镇、诗礼乡、新华彝族苗族乡、大寺乡、腰街彝族乡、郭大寨彝族白族乡。共有4个居委会、183个行政村。县政府驻凤山镇。
2010年第六次人口普查，凤庆县常住总人口458322人，其中：凤山镇79857人，鲁史镇29994人，小湾镇27547人，营盘镇45709人，三岔河镇28708人，勐佑镇51213人，雪山镇30953人，洛党镇40072人，诗礼乡26124人，新华乡27912人，大寺乡38098人，腰街乡9233人，郭大寨乡22902人。