会泽名之来由，盖因，境内壁谷小江与金沙江会，东洪江与牛栏江会，至与鲁甸分界处牛栏江与金沙江又会，以数水所会定名，故名会泽。会泽开发垦殖甚早，《华阳国志·蜀志》说，秦、汉修“五尺道”和南夷道，都以焚道为起点，向南延伸，从会无县渡泸得堂狼（即会泽县）。
西汉建元六年（公元前135年）置堂琅县，属犍为郡，东汉属犍为国都尉，三国蜀汉为堂琅县，分犍为立朱提郡【一说，汉武帝建元六年（前135）为三绛县，东汉永初元年（107）为堂琅县】。隋朝属恭州地。唐武德四年（621）改为唐兴县，唐咸通年间为南诏国东川郡。宋大理段氏设东川大都督，后为乌蛮閟畔部，元初置閟畔万户府，至元十五年（1278）改閟畔军民总管府，二十八年（1291）立东川路，明洪武十四年（1381）开置东川土府，隶云南布政使司，十六年（1383）改隶四川，为东川军民府。
清顺治十六年（1659）称东川府内附，康熙三十七年（1699）改设流官。康熙三十八年（1699）为东川府。雍正五年（1727）置会泽县，以征粮不便，东川府又折出四川，改隶云南布政使司，会泽县驻巧家，翌年迁到钟屏。民国二年（1913），裁东川府，改名东川县，属云南滇中道。1929年改名会泽县（一说为1919年，又一说为1927年），1947年属曲靖专署。
1949年获得解放，以后隶属昭通专区。1954由会泽县境划出汤山、因民、新村、布卡等四区成立东川矿区，由省直辖。1958年10月成立东川市，撤会泽县划为会泽、迤车、者海、待补四个联社隶属东川市（一说为东川市会泽区）。1965年恢复会泽县，改隶曲靖专区。1970年属曲靖地区，1997属地级曲靖市。
1997年，会泽县面积5886.3平方千米，人口约83.8万人。辖7个镇、17个乡：钟屏镇、娜姑镇、迤车镇、罗布古镇、者海镇、矿山镇、待补镇、金钟乡、大海乡、老厂乡、五星乡、大桥乡、梨园乡、马路乡、纸厂乡、火红乡、乐业乡、新街回族乡、大井乡、雨碌乡、鲁纳乡、上村乡、驾车乡、田坝乡。县政府驻钟屏镇。
2000年第五次人口普查，会泽县常住总人口844485人，其中：钟屏镇21916人，娜姑镇62759人，迤车镇55408人，罗布古镇30013人，矿山镇22437人，者海镇91432人，待补镇44056人，纸厂乡15227人，梨园乡15220人，马路乡22711人，火红乡27058人，乐业乡32696人，大井乡36769人，新街乡30991人，金钟乡102734人，雨碌乡33199人，大海乡25473人，鲁纳乡20465人，老厂乡17725人，上村乡29267人，五星乡25411人，驾车乡25210人，大桥乡25263人，田坝乡31045人。
2001年12月18日，云南省政府（云政复[2001]220号）批准同意撤销会泽县钟屏镇、金钟乡，设立金钟镇。至此，全县辖7个镇、15个乡、1个民族乡：金钟镇、娜姑镇、罗布镇、者海镇、待补镇、矿山镇、迤车镇、大桥乡、五星乡、雨碌乡、上村乡、大海乡、乐业乡、架车乡、鲁纳乡、火红乡、田坝乡、纸厂乡、大井乡、梨园乡、马路乡、老厂乡、新街回族乡。
2002年9月8日，省政府批准同意大井乡撤乡设镇。2003年末，全县辖金钟、大井、娜姑、迤车、罗布古、者海、矿山、待补8个镇和纸厂、梨园、马路、火红、乐业、新街、雨碌、大海、鲁纳、老厂、上村、五星、驾车、大桥、田坝15个乡，下设361个行政村、15个社区。总人口数为90.41万人，其中农业人口83.49万人，非农业人口6.93万人。每平方千米人口密度154人。共有21个民族，少数民族人口4.55万人，占总人口的5.03%。2005年末，全县总人口93.59万人，其中：农业人口86.34万人，占总人口的92.25%。
2006年3月16日，省政府批准同意：撤销梨园乡，其行政区域并入迤车镇，迤车镇政府驻地不变；撤销乐业乡和罗布古镇，设立乐业镇，新设立的乐业镇管辖原乐业乡和罗布古镇管辖的行政区域范围，镇政府驻原罗布古镇政府驻地。
2006年，全县总面积6077平方千米。总人口89.35万人。辖8个镇、13个乡（其中1个民族乡）：金钟镇、娜姑镇、迤车镇、矿山镇、者海镇、待补镇、大井镇、乐业镇、纸厂乡、马路乡、火红乡、新街回族乡、雨碌乡、大海乡、鲁纳乡、老厂乡、上村乡、五星乡、驾车乡、大桥乡、田坝乡。共有15个居委会、361个行政村。县政府驻金钟镇。
2010年第六次人口普查，会泽县常住总人口908292人，其中：金钟镇154328人，娜姑镇61124人，迤车镇81784人，乐业镇70209人，矿山镇23559人，者海镇92108人，大井镇38243人，待补镇40779人，大海乡24106人，老厂乡19925人，五星乡29498人，大桥乡30816人，纸厂乡16729人，马路乡26128人，火红乡32223人，新街乡26948人，雨碌乡34478人，鲁纳乡18065人，上村乡33721人，驾车乡22373人，田坝乡31148人。
2013年10月20日，省政府（云政复[2013]77号）批准同意撤销金钟镇。会泽县撤销金钟镇，设立金钟街道、古城街道、宝云街道；保留娜姑镇、迤车镇、乐业镇、者海镇、待补镇、矿山镇、大井镇和大海乡、老厂乡、五星乡、大桥乡、纸厂乡、马路乡、火红乡、雨碌乡、鲁纳乡、上村乡、驾车乡、田坝乡、新街回族乡。调整后，会泽县辖3个街道、7个镇、13个乡。2014年，待补镇、迤车镇被列为全国重点镇。