昌都市辖1个市辖区，10个县：卡若区，江达县，贡觉县，类乌齐县，丁青县，察雅县，八宿县，左贡县，芒康县，洛隆县，边坝县。共有28个镇，110个乡。市政府驻卡若区昌都西路378号。
卡若区辖3个镇，12个乡：城关镇，俄洛镇，卡若镇，芒达乡，沙贡乡，若巴乡，埃西乡，如意乡，日通乡，柴维乡，妥坝乡，嘎玛乡，面达乡，约巴乡，拉多乡。区政府驻城关镇昌都中路259号。
江达县辖2个镇，11个乡：江达镇，岗托镇，邓柯乡，岩比乡，卡贡乡，生达乡，娘西乡，字呷乡，青泥洞乡，汪布顶乡，德登乡，同普乡，波罗乡。县政府驻江达镇。
贡觉县辖1个镇，11个乡：莫洛镇，敏都乡，则巴乡，罗麦乡，沙东乡，克日乡，木协乡，阿旺乡，拉妥乡，雄松乡，哈加乡，相皮乡。县政府驻莫洛镇。
类乌齐县辖2个镇，8个乡：桑多镇，类乌齐镇，吉多乡，岗色乡，滨达乡，卡玛多乡，尚卡乡，伊日乡，加桑卡乡，长毛岭乡。县政府驻桑多镇热扎卡。
丁青县辖2个镇，11个乡：丁青镇，尺牍镇，沙贡乡，木塔乡，布塔乡，巴达乡，甘岩乡，嘎塔乡，色扎乡，协雄乡，桑多乡，当堆乡，觉恩乡。县政府驻丁青镇。
察雅县辖3个镇，10个乡：烟多镇，吉塘镇，香堆镇，宗沙乡，肯通乡，卡贡乡，扩达乡，新卡乡，王卡乡，阿孜乡，巴日乡，荣周乡，察拉乡。县政府驻烟多镇。
八宿县辖4个镇，10个乡：白玛镇，然乌镇，帮达镇，同卡镇，林卡乡，夏里乡，拥巴乡，瓦乡，吉达乡，卡瓦百庆乡，吉中乡，益庆乡，拉根乡，郭庆乡。县政府驻白玛镇。
左贡县辖3个镇，7个乡：旺达镇，田妥镇，扎玉镇，东坝乡，中林卡乡，美玉乡，下林卡乡，碧土乡，仁果乡，绕金乡。县政府驻旺达镇。
芒康县辖2个镇，14个乡（包括1个民族乡）：嘎托镇，如美镇，曲孜卡乡，木许乡，纳西族乡，朱巴龙乡，曲登乡，徐中乡，帮达乡，戈波乡，洛尼乡，措瓦乡，昂多乡，宗西乡，莽岭乡，索多西乡。县政府驻嘎托镇。
洛隆县辖4个镇，7个乡：孜托镇，硕督镇，康沙镇，马利镇，玉西乡，新荣乡，达龙乡，腊久乡，俄西乡，中亦乡，白达乡。县政府驻孜托镇。
边坝县辖2个镇，9个乡：草卡镇，边坝镇，马武乡，热玉乡，尼木乡，沙丁乡，金岭乡，加贡乡，马秀乡，都瓦乡，拉孜乡。县政府驻草卡镇东马通。