昌吉回族自治州总面积73660.41平方千米。总人口137万人。辖2个县级市、4个县、1个自治县：昌吉市、阜康市和玛纳斯县、呼图壁县、吉木萨尔县、奇台县、木垒哈萨克自治县。境内还有新疆生产建设兵团的24个团场。州政府驻昌吉市延安北路10号。
昌吉市总面积7981.13平方千米。总人口36万人。辖6街道、6镇、3乡、1民族乡：延安北路街道、北京南路街道、绿洲路街道、中山路街道、宁边路街道、建国路街道、硫磺沟镇、三工镇、榆树沟镇、六工镇、二六工镇、大西渠镇、佃坝乡、滨湖乡、庙尔沟乡、阿什里哈萨克族乡。境内有园艺场、共青团农场、军户农场、下巴湖农场、老农河农区、林木种苗场、良种场、水利厅水土改良实验场、商业厅农场、农六师师部、农六师一〇一团、农六师一〇三团。市政府驻延安北路。
阜康市总面积8844.85平方千米，总人口17万人。辖3个街道、4个镇、1个乡、2个民族乡：博峰街街道、阜新街街道、准东街道、甘河子镇、城关镇、九运街镇、滋泥泉子镇、三工河哈萨克族乡、上户沟哈萨克族乡、水磨沟乡。境内有准东石油勘探开发公司、有色管理处、种羊场、小泉牧场、五宫煤矿、兵团农六师土墩子农场、六运湖农场、兵团二二二团农场。市政府驻博峰街。
呼图壁总面积9518.45平方千米，总人口21万人。辖6个镇、2个民族乡：呼图壁镇、大丰镇、雀尔沟镇、廿里店镇、园户村镇、五工台镇、石梯子哈萨克民族乡、独山子哈萨克族乡。境内有南山牧场、良种繁育场、干河子林场、塔勒得牧场、林场、种牛场、种畜场、一〇五团、一〇六团、一一一团、农六师芳草湖总场。县政府驻呼图壁镇。
玛纳斯县总面积9154.48平方千米，总人口17万人。辖7个镇、1个乡、3个民族乡：玛纳斯镇、乐土驿镇、包家店镇、凉州户镇、北五岔镇、六户地镇、兰州湾镇、广东地乡、清水河哈萨克族乡、塔西河哈萨克族乡、旱卡子滩哈萨克族乡。境内有玛纳斯发电有限责任公司、玛纳斯园艺场、玛纳斯平原林场、农科院玛纳斯试验站、农六师新湖农场、农八师一四七团场、农八师一四八团场、农八师一四九团场、农八师一五〇团场。县政府驻玛纳斯镇。
奇台县总面积16709.36平方千米，总人口23万人。辖6个镇、6个乡、3个民族乡：奇台镇、老奇台镇、半截沟镇、吉布库镇、东湾镇、西地镇、碧流河乡、西北湾乡、坎尔孜乡、五马场哈萨克族乡、古城乡、乔仁哈萨克族乡、七户乡、三个庄子乡、大泉塔塔尔族乡。境内有兵团一〇八团、兵团一〇九团、兵团一一〇团、兵团奇台农场、农六师北塔山牧场。县政府驻奇台镇。
吉木萨尔县总面积8169.86平方千米，总人口14万人。辖4个镇、5个乡：吉木萨尔镇、三台镇、泉子街镇、北庭镇、二工乡、庆阳湖乡、老台乡、大有乡、新地乡。境内有农六师红旗农场、农六师一〇七团。县政府驻吉木萨尔镇。
木垒哈萨克自治县总面积17700平方千米，总人口9万人。辖3个镇、7个乡、1个民族乡：木垒镇、西吉尔镇、东城镇、英格堡乡、照壁山乡、新户乡、雀仁乡、白杨河乡、大石头乡、大南沟乌孜别克族乡、博斯坦乡。境内有良种场、克热克库都克牧场。县政府驻木垒镇。