喀什是维吾尔语“喀什噶尔”音译的简称，其语源有突厥语、古伊兰语、波斯语等融演而成，含意有“各色砖房”、“玉石集中之地”、“初创”等不同的解释。今日的喀什地区古代称疏勒、任汝、疏附，包括古代的疏勒（今喀什市、疏附县、疏勒县、伽师县一带）、蒲犁（今塔什库尔干）、莎车、依耐（今英吉沙和阿克陶境内）、乌禾宅 （今塔什库尔干南部）、西夜（今叶城）等诸国地。秦末汉初，这些地方属于匈奴的僮仆都尉管辖。汉武帝元狩四年（公元前119年），汉博望候张骞奉旨通西域时进驻疏勒，这里始为汉朝所控制。公元前60年，汉朝在新疆设置西域都护府，喀什作为西域的一部分，正式列入祖国版图。
唐太宗以后，这里为唐朝政府的重要军事据点，当时的安西四镇之一即为喀什噶尔。五代至宋，先后为喀喇汗王朝和西辽所管辖。喀喇汗王朝时期，曾以喀什噶尔为首府。成吉思汗西征后，属次子察合台太子的封地。叶尔羌汗国时，喀什曾作为辅助中心，起着重要的作用。清乾隆时期这儿是清政府“总理南八城事宜”的喀什噶尔参赞大臣的驻地。光绪十年（1884年），置喀什噶尔道，共辖有疏勒、莎车两个府和英吉沙尔直隶厅、蒲犁分防厅、和阗直隶州。
民国年间改为喀什行政区，设行政长公署于疏附。民国32年（1943）改名新疆第三（喀什）行政区。还有第十（莎车）行政区。解放后建立了喀什专区和莎车专区。1956年撤销莎车专区，并入喀什专区，1971年1月，喀什专区改为喀什地区。
1982年11月6日，喀什行署决定，将喀什市浩罕、伯什克然木、阿瓦提、英吾斯坦4个公社及河内林场划归疏附县。
1998年3月1日，经自治区政府批准，将疏附县浩罕乡、伯什克然木乡5个村、阿瓦提乡2个村、帕哈太克里乡1个村、疏勒县城关镇1个村的3个村民小组划归喀什市管辖。1998年底，喀什地区总人口为327．95万人，其中少数民族人口占总人口的90．97％。
2000年第五次全国人口普查，喀什地区常住总人口3405713人。其中：喀什市340640人、疏附县345282人、疏勒县284853人、英吉沙县213338人、泽普县181721人、莎车县620329人、叶城县370229人、麦盖提县201810人、岳普湖县129441人、伽师县311733人、巴楚县375883人、塔什库尔干县30454人。
2001年末，全区总人口342.68万人，其中少数民族人口占总人口的90%。2002年末，全区总人口348.76万人，其中城镇人口70.58万人。
2003年末，喀什地区总人口3501198人，其中城镇人口81.95万人。辖1个市、11个县，共有8个区公所，26个镇、4个街，141个乡，2310个村委会、96个居委会。境内还驻有新疆生产建设兵团农业第三师所辖16个团场以及自治区属管单位、农场、石油基地、军事机关等单位。
2004年末，喀什地区总人口361.54万人，其中城镇人口83.42万人。
2004年8月2日，经自治区政府批准，将疏附县的色满乡、荒地乡划归喀什市管辖。2005年2月24日，经自治区政府批准，将疏附县的帕哈太克里乡、伯什克然木乡划归喀什市管辖。
2010年第六次人口普查，喀什地区常住总人口3979321人，其中：喀什市506640人，疏附县311960人，疏勒县312455人，英吉沙县262067人，泽普县206936人，莎车县762385人，叶城县454328人，麦盖提县258978人，岳普湖县147688人，伽师县381767人，巴楚县336274人，塔什库尔干塔吉克自治县37843人。
2013年3月，自治区政府（新政函[2013]35号）同意将疏附县阿瓦提乡划归喀什市管辖；同年，自治区政府（新政函[2013]207号）批准同意将疏附县英吾斯坦乡划归喀什市管辖（11月20日正式实施）。2014年10月21日，自治区政府（新政函[2014]194号）同意将疏附县阿克喀什乡划归喀什市管辖。