秦（公元前221年）始设驺县，唐初改驺县为邹县。县因山名。《今县释名》：“秦置，故邾国，曹姓，颛顼之后，赵岐曰，鲁缪公改邾曰驺，六书故，邾邹同声，春秋时邾用夷，故谓之邾娄，合邹邾之音为邹，故邾改名邹也。”一说“鲁穆公改驺山从邑，故谓邹山。”1992年10月4日，撤销邹县，设立邹城市，以原邹县的行政区域为邹城市的行政区域。
1989年11月18日，撤销邹县峄山乡，设立峄山镇；撤销看庄乡，设立看庄镇。1994年1月28日，撤销邹城市郭里乡、张庄乡、田黄乡，设立郭里镇、张庄镇、田黄镇。
1996年，邹城市面积1613平方千米，人口107.6万人。辖15个镇、5个乡：邹城镇、峄山镇、看庄镇、香城镇、张庄镇、城前镇、田黄镇、大束镇、中心店镇、平阳寺镇、北宿镇、唐村镇、太平镇、石墙镇、郭里镇、王村乡、大律乡、尚河乡、匡庄乡、古路口乡。市政府驻邹城镇。
2000年第五次人口普查，邹城市总人口1101003人，其中：邹城镇264153人，峄山镇49677人，看庄镇35459人，香城镇50380人，张庄镇38098人，城前镇44623人，田黄镇39595人，大束镇46242人，中心店镇75933人，北宿镇83617人，唐村镇38070人，平阳寺镇47842人，太平镇62244人，郭里镇43555人，石墙镇46088人，王村乡24072人，大律乡23375人，尚河乡34209人，匡庄乡27203人，古路口乡26567人。
2000年12月1日，山东省政府（鲁政函民字[2000]67号）批准：撤销邹城镇，设立钢山、千泉、凫山3个街道办事处。钢山街道办事处辖北关、西关、岗山、孟庄4个居委会和岗山、苏庄、曾沟、李官、红新、杨下、汪庄、杜庄、朱山、前八里沟、后八里沟、崇义、程兰、王兰等14个行政村，办事处机关驻西苇路西段；千泉街道办事处辖东关、南关、大胡、马庄4个居委会和郭庄、兴隆、十里、小屈、大屈、九里、宝泉、小胡、南岭、尚兰、欧兰、程沟、张沟、小张庄、大西苇、小西苇等16个行政村，办事处机关驻原邹城镇政府驻地；凫山街道办事处辖凫山、三里两个居委会和前庙、后庙、和睦、巷里、周庄、石庄、东沙、西沙、北沙、南沙、田庄、五里、梁岗等13个行政村，办事处机关驻建设路中段。撤销王村乡，将其行政区域并入香城镇；撤销大律乡，将其行政区域并入张庄镇；撤销匡庄乡，将其行政区域并入大束镇；撤销尚河乡，将其行政区域并入城前镇；撤销古路口乡，将其行政区域并入石墙镇。至此，邹城市辖3个街道、14个镇。
邹城市总面积1613平方千米，总人口1120404人。辖3个街道、14个镇：钢山街道、千泉街道、凫山街道、峄山镇、看庄镇、香城镇、张庄镇、城前镇、田黄镇、大束镇、中心店镇、北宿镇、唐村镇、太平镇、平阳寺镇、郭里镇、石墙镇。共17个居委会、871个村委会，943个自然村。（根据“济宁地名网”，估计为2004年统计数据）
2007年底，全市总面积1613平方千米。总人口113.59万人。辖3个街道、14个镇：钢山街道、千泉街道、凫山街道、香城镇、城前镇、大束镇、北宿镇、中心店镇、唐村镇、太平镇、平阳寺镇、石墙镇、峄山镇、看庄镇、张庄镇、田黄镇、郭里镇，共有891个行政村（居委会）。
2008年，撤销平阳寺镇，并入太平镇。调整后，全市辖3个街道、13个镇：钢山街道、千泉街道、凫山街道、香城镇、城前镇、大束镇、北宿镇、中心店镇、唐村镇、太平镇、石墙镇、峄山镇、看庄镇、张庄镇、田黄镇、郭里镇。市政府驻钢山街道。