1991年5月7日，经潍坊市人民政府批准，设立城区街道办事处。1992年1月24日，撤销东庄乡，设立河滩镇；撤销里疃乡，设立张氏镇；撤销郭家官庄乡，设立郭家官庄镇。
1994年5月23日，将郭家官庄镇的李家朱茂、杜家朱茂、玄家朱茂、辛庄、王家潭里、小南潭、西金马、东金麻8个村划归新设立的奎文区。
1998年，寒亭区面积781平方千米，人口35万。辖1个街道、9个镇、3个乡：城区街道、寒亭镇、央子镇、固堤镇、高里镇、河滩镇、双杨店镇、朱里镇、郭家官庄镇、张氏镇、泊子乡、萧家营乡、南孙乡。区政府驻寒亭镇。
2000年第五次人口普查，寒亭区总人口355945人，其中：城区街道50564人，寒亭镇37725人，固堤镇29717人，央子镇9389人，高里镇30548人，双杨店镇32022人，朱里镇30546人，张氏镇22672人，郭家官庄镇15051人，河滩镇31207人，泊子乡29401人，肖家营乡14217人，南孙乡22886人。
截至2002年12月31日，全区总面积898平方千米。辖2个街道、6个镇、2个乡，409个行政村（居委会）。年底全区总人口35.58万人,其中非农业人口6.41万人。
2003年底，全区总面积872.3平方千米。人口33.88万人，其中非农业人口7.55万人。辖2个街道、6个镇、2个乡：寒亭街道、开元街道、固堤镇、央子镇、高里镇、双杨店镇、朱里镇、河滩镇、泊子乡、南孙乡。共有375个行政村（居委会）。
2007年，撤销央子镇，设立央子街道；撤销泊子乡、固堤镇，设立固堤街道；撤销双杨店镇、南孙乡，并入高里镇；撤销河滩镇，并入朱里镇。同时，将寿光市的大家洼街道划归寒亭区管辖。
2008年2月28日，潍坊滨海经济开发区管委会正式开会通告：根据潍坊市委、市政府的意见，将寒亭区央子街道办事处委托潍坊滨海经济开发区管理。
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