秦为成都县地，唐贞观十七年（643）析成都县置蜀县，乾元元年（758）蜀县更名华阳县。1953年更名东城区。1990年撤销东城区，其主体部分改置锦江区。
1996年，锦江区面积62.1平方千米，人口约41.3万人。辖17街道2乡：春熙路街道、人民南路街道、王家坝街道、莲花池街、均隆街街道、芷泉街街道、和平街街道、天涯石北街街道、梓潼桥正街街道、东丁字街街道、镋钯[tǎngbǎ]街街道、东糠市街街道、东风南路街道、伴仙街街道、沙河铺街道、盐市口街道、牛市口街道、琉璃乡、三圣乡。
2000年第五次人口普查，锦江区常住总人口440280人，其中（18个街道、2个乡）：东糠市街道15573人，天涯石北街街道12942人，和平街街道21524人，梓潼桥正街街道11654人，春熙路街道4812人，盐市口街道12528人，人民南路街道9187人，青石桥街道10915人，王家坝街道15347人，均隆街街道15232人，镋钯街街道15575人，芷泉街街道12116人，合江亭街道16981人，牛市口街道46972人，东风南路街道11787人，伴仙街街道30737人，沙河铺街道57984人，东光街道36244人，琉璃场乡46754人，三圣乡35416人。
2001年12月，锦江区行政区划调整，将原来城区19个街道撤并为13个：撤销人民南路、天涯石北街、王家坝、青石桥、东糠市街、均隆街、伴仙街、芷泉街、和平街、梓潼桥正街、镋钯街、沙河铺等12个街道，调整设置督院街、书院街、合江亭、水井坊、龙舟路、莲新街、双桂路、沙河等8个街道，对盐市口、春熙路、牛市口等3个街道进行了部分区域性调整；东光、狮子山2个街道保留未动。17日，13个新组建的街道办事处正式挂牌成立。调整后，锦江区辖15个街道、2个乡。
2003年12月8日，省政府（川府民政[2003]32号）批复同意锦江区三圣乡政府驻地由高店子迁至粉坊堰村3组成龙路南侧四川省消防指挥学校对面。
2004年1月8日，省政府（川府民政[2004]1号）批复同意锦江区撤销琉璃乡建制。2月，市政府同意锦江区撤销琉璃场街道办事处建制，设置柳江、成龙路街道办事处建制等相关行政区划调整方案：撤销琉璃场街道办事处建制；设置柳江、成龙路街道办事处建制；将三圣乡部分行政区域及原琉璃乡以北部分区域划归成龙路街道办事处；将原琉璃乡部分区域划归柳江街道办事处；将原琉璃乡部分区域划归三圣乡。2月26日，柳江、成龙路2个街道办事处正式挂牌成立。9月21日，省政府（川府民政[2004]45号）批复同意撤销三圣乡建制，所属行政区域实行街道办事处管理体制。
2004年，锦江区总面积60平方千米，人口密度6524人/平方千米。辖督院街、盐市口、春熙路、书院街、合江亭、水井坊、牛市口、龙舟路、双桂路、狮子山、莲新、沙河、东光、成龙路、柳江、三圣16个街道，44个社区、17个行政村。
2010年第六次人口普查，锦江区常住总人口690422人，其中：督院街街道25687人，盐市口街道11211人，春熙路街道22216人，书院街街道48078人，合江亭街道45090人，水井坊街道27265人，牛市口街道46741人，龙舟路街道45260人，双桂路街道24384人，莲新街道59870人，沙河街道13710人，东光街道65616人，狮子山街道64826人，成龙路街道113750人，柳江街道52247人，三圣街道24471人。