古为羌地。魏晋南北朝属苏毗国，唐为吐蕃辖地，元属“朵甘”地域，隶吐蕃等路宣慰使司，明属朵甘思宣慰使司，明末清初属和硕特蒙古政权辖地，后归钦差总理青海蒙古蕃子事务大臣衙门管理。
民国初隶青海办事长官和西宁镇总兵，旋改隶蒙蕃宣慰使和甘边宁海镇守使，民国六年（1917年）属玉树理事，后归玉树县辖，民国二十六年（1937年）由玉树县析置称多县。1951年沿旧制成立称多县政府，隶玉树藏族自治区（州）。
1999年末，面积13827平方千米，人口39106人（根据青海省志），辖8个乡。县政府驻周筠（在称文乡境内）（省志为周均）。
2000年第五次人口普查，称多县总人口40391人，其中：扎朵乡6284人，清水河乡6232人，珍秦乡7503人，尕朵乡5021人，赛河乡1022人，歇武乡4321人，拉布乡2979人，称文乡3388人，周均未批镇3641人。
2001年10月15日，青海省政府青政函[2001]99号文批复：撤销赛河、称文两乡，合并设立称文镇（镇政府驻地设在原称文乡址）；撤销歇武乡，设立歇武镇；撤销扎朵乡，设立扎朵镇；撤销清水河乡，设立清水河镇。调整后，称多县辖4个镇、3个乡：称文镇、歇武镇、扎朵镇、清水河镇、拉布乡、尕朵乡、珍秦乡。
2001年末，称多县辖4个镇、3个乡，共有57个村（牧）委会。称文镇驻尕藏寺，辖上庄、下庄、雪吾、松当、白龙、刚查、拉贡、赛河、阿多、者贝、芒查11个村（牧）委会。歇武镇驻歇武，辖歇武、当巴、直门达、上赛巴、下赛巴、阿卓茸巴、牧业村7个牧委会。清水河镇驻清水河，辖扎玛、扎哈、普桑、中卡、尕青、文措、红旗7牧委会。扎朵镇驻下河，辖治多、直美、红旗、格新、东方红、向阳6个牧委会。拉布乡驻拉司通，辖吾海、拉司通、郭吾、兰达、达哇、德达、帮布7个牧委会。尕朵乡驻卡龙，辖卡龙、卡吉、科玛、布由、吉新、岗由、着木其、吾云达8个牧委会。珍秦乡驻竹节寺，辖一、二、三、四、五、六、七、八、九、十、十一11个牧委会。
2006年8月，撤销珍秦乡，设立珍秦镇。调整后，称多县辖5个镇、2个乡：称文镇、歇武镇、扎朵镇、清水河镇、珍秦镇、拉布乡、尕朵乡。