截至2020年3月，吴忠市利通区辖8个镇、4个乡（共12个乡级单位）：金积镇、金银滩镇、高闸镇、扁担沟镇、上桥镇、古城镇、金星镇、胜利镇、东塔寺乡、板桥乡、马莲渠乡、郭家桥乡。区政府驻金星镇朝阳东街131号。
【统计用区划代码及城乡分类代码（2019年）】
640302000利通区
640302100金积镇: 640302100003 121金丰社区, 640302100200 121西门村, 640302100201 121北门村, 640302100202 121东门村, 640302100203 122关渠村, 640302100204 220黎花桥村, 640302100205 220马家桥村, 640302100206 220芦沟闸村, 640302100207 220河渠拜村, 640302100208 220丁家湾子村, 640302100209 220塔湾村, 640302100210 220大庙桥村, 640302100211 220秦坝关村, 640302100212 220大院子村, 640302100213 220露天洼子村, 640302100214 220郝渠村, 640302100215 220油粮桥村, 640302100216 220田桥村
640302101金银滩镇: 640302101002 220巴浪湖社区, 640302101200 220四支渠村, 640302101201 220灵白村, 640302101202 220银新村, 640302101203 121沟台村, 640302101204 220西滩村, 640302101205 220团庄村, 640302101206 220杨马湖村, 640302101207 220新渠村, 640302101208 220东沟湾村, 640302101500 220良繁, 640302101501 220金川, 640302101502 220园艺场
640302102高闸镇: 640302102200 220郭桥村, 640302102201 220周闸村, 640302102202 122韩桥村, 640302102203 121高闸村, 640302102204 121朱渠村, 640302102205 220李桥村, 640302102206 220马家湖村, 640302102500 220关马湖农场
640302103扁担沟镇: 640302103200 220扁担沟村, 640302103201 220烽火墩村, 640302103202 121高糜子湾村, 640302103203 122双吉沟村, 640302103204 220渠口村, 640302103205 220黄沙窝村, 640302103206 220海子井村, 640302103207 220西沟沿村, 640302103208 220南梁村, 640302103209 220五里坡村, 640302103210 220同利村, 640302103211 220石家窑村, 640302103212 220赵家沟村, 640302103213 220渔光湖村, 640302103214 220吴家沟村, 640302103500 220良繁场
640302104上桥镇: 640302104200 111瓜儿渠村, 640302104201 111上桥村, 640302104202 111花寺村, 640302104203 112涝河桥村, 640302104204 112牛家坊村, 640302104205 111八家坊村, 640302104206 111官田村, 640302104207 111罗渠村
640302105古城镇: 640302105001 111怡园社区, 640302105002 111清宁河社区, 640302105200 112古城村, 640302105201 111红星村, 640302105202 111左营村, 640302105203 111五星村, 640302105204 112金星村, 640302105205 112朝阳村, 640302105206 112新生村, 640302105207 112秦桥村, 640302105208 112黎明村, 640302105209 112党家河湾村, 640302105210 220新华桥村
640302106金星镇: 640302106001 111富平社区, 640302106002 111金花园居委会, 640302106003 111开元居委会, 640302106004 111裕西居委会, 640302106005 111金塔居委会, 640302106006 111明珠社区, 640302106007 111材机居委会, 640302106008 111金星花园社区, 640302106009 111利宁社区, 640302106010 111阳光骄子社区
640302107胜利镇: 640302107001 111中华居委会, 640302107002 111朝阳居委会, 640302107003 111上桥居委会, 640302107004 111新华居委会, 640302107005 111秦渠居委会, 640302107006 111永昌居委会, 640302107007 111民生居委会, 640302107008 111富荣社区
640302200东塔寺乡: 640302200200 111柴园村, 640302200201 111李园村, 640302200202 220石佛寺村, 640302200203 220刘碱滩村, 640302200204 220洼路沟村, 640302200205 220二道桥村, 640302200206 111塔寺村, 640302200207 220干饭渠村, 640302200208 220新接堡村, 640302200209 220白寺滩村
640302201板桥乡: 640302201200 111蔡桥村, 640302201201 111板桥村, 640302201202 220任桥村, 640302201203 220波浪渠村, 640302201204 111高家湖村, 640302201205 112巷道村, 640302201206 111梁湾村, 640302201207 111李闸渠村, 640302201208 112罗家湖村, 640302201209 112洼渠村, 640302201210 220早元村
640302202马莲渠乡: 640302202200 220杨渠村, 640302202201 210柴桥村, 640302202202 210马莲渠村, 640302202203 210岔渠桥村, 640302202204 220汉北堡村, 640302202205 220巴浪湖村, 640302202206 220廖桥村, 640302202207 220陈木闸村
640302203郭家桥乡: 640302203200 220杨家岔村, 640302203201 220吴家桥村, 640302203202 210郭家桥村, 640302203203 210刘家湾村, 640302203204 210山水沟村, 640302203205 220清水沟村, 640302203206 220涝河桥村, 640302203207 210马家大湾村
640302401孙家滩管委会: 640302401501 123种畜场, 640302401599 220贮草站