1969年将内蒙古自治区巴彦淖尔盟的额济纳旗和阿拉善右旗划归甘肃省；阿拉善左旗划归宁夏回族自治区。1979年将甘肃省的额济纳旗、阿拉善右旗，宁夏回族自治区的阿拉善左旗划入内蒙古自治区，设立阿拉善盟。
2000年第五次人口普查，阿拉善盟总人口196279人。其中：阿拉善左旗148672人、阿拉善右旗25281人、额济纳旗22326人。
2006年5月，自治区人民政府正式批复阿拉善盟《关于调整全盟苏木镇行政区划的请示》，同意阿拉善盟关于调整撤并部分苏木镇的意见。这是阿拉善盟苏木镇机构改革继2001年改一革后的又一次重大调整。调整撤并后，三旗原有的40个苏木镇调整为23个。 阿左旗将原有23个苏木镇调整为13个。其中将通古勒格淖尔苏木和木仁高勒苏木，并入巴彦浩特镇；撤销豪斯布尔都苏木，并入巴彦诺日公苏木；撤销古拉本敖包镇，并入宗别立镇；撤销锡林高勒镇、巴彦洪格日苏木，并入吉兰泰镇；撤销超格图呼热苏木整建并入嘉尔格勒赛汉镇；撤销查干布拉格苏木，并入额尔克哈什哈苏木；撤销银根苏木，并入乌力吉苏木；撤销图克木苏木，并入敖伦布拉格镇。撤并调整后，阿左旗设13个苏木镇，其中建制镇8个，苏木5个，即巴彦浩特镇、吉兰泰镇、乌素图镇、嘉尔格勒赛汉镇、宗别立镇、巴润别立镇、敖伦布拉格镇、温都尔勒图镇，乌力吉苏木、巴彦诺日公苏木、巴彦木仁苏木、额尔克哈什哈苏木、腾格里额里斯苏木。 阿右旗将原有的9个苏木镇调整撤并为5个。其中，撤销额日布盖苏木，并入额肯呼都格镇；撤销塔木素格布拉格镇，并入阿拉腾敖包苏木（改为阿拉腾敖包镇）；撤销曼德拉苏木，并入孟根布拉格苏木；撤销努日布盖苏木，并入阿拉腾朝克苏木；保留雅布赖镇。调整撤并后，阿右旗苏木镇行政区划结构为镇建制3个，苏木建制2个，即额肯呼都格镇、雅布赖镇、阿拉腾敖包镇和孟根布拉格苏木、阿拉腾朝克苏木。 额旗将原有的8个苏木镇调整为5个苏木镇，撤销合并苏木镇3个。其中，将温图高勒苏木并入达来呼布镇；撤销古日乃苏木和巴彦宝格德苏木并入新建的东风镇。此外，原苏泊淖尔苏木、赛汉桃来苏木、马鬃山苏木保留，行政区域不变。
2006年，将阿拉善左旗乌素图镇更名为乌斯太镇。2009年，阿拉善左旗撤销腾格里额里斯苏木，设立腾格里额里斯镇；将巴镇额鲁特、南环路、新华、王府4个办事处从巴镇管辖范围中划分出来，为旗委、旗政府派出机构，机构规格为正科级，分设后，四个街道办事处名称统一规范为“阿拉善左旗巴彦浩特××××街道办事处”；额济纳旗将马鬃山苏木的乌兰乌拉嘎查划出设立哈日布日格德音乌拉（黑鹰山）镇。
2009年末，全盟总面积27万平方千米，常住总人口22.39万人，其中城镇人口16.94万人。辖14个镇、10个苏木，191个嘎查（村）、53个社区。阿拉善左旗总面积80412平方千米，总人口142972人。阿拉善右旗总面积73443平方千米，总人口24577人。额济纳旗总面积11.46万平方千米，总人口17108人。（内蒙古年鉴数据；本站注：应为15个镇、9个苏木）
2011年，阿拉善右旗额肯呼都格镇更名为巴丹吉林镇。2011年末（2012年初），阿拉善左旗从乌力吉苏木、嘉尔嘎勒赛汉镇划出部分区域设立银根苏木、超格图呼热苏木，阿拉善右旗从阿拉腾敖包镇、巴丹吉林镇划出部分区域设立塔木素布拉格苏木、巴彦高勒苏木，额济纳旗从达来呼布镇划出部分区域设立巴彦陶来苏木、温图高勒苏木。