“鄂温克”为鄂温克族人的自称，意为“住在山林中的人”。1732年清政府从布特哈迁来鄂温克族、达斡尔族、巴尔虎蒙古族、鄂伦春族兵丁及家属建索伦八旗。1790年杜尔伯特太吉率三氏蒙古族厄鲁特部迁锡尼河流域，也被编入索伦八旗。1928年建厄鲁特旗。1917～1928年间苏联境内的部分蒙古族布利亚特部迁至伊敏河、锡尼河一带，于1921年建布利亚特旗。1932年将索伦八旗、布利亚特旗、厄鲁特旗合并建索伦旗。1958年改鄂温克族自治旗。
1996年?，鄂温克族自治旗面积1911平方千米，人口14万人，其中鄂温克族0.9万人，达斡尔族1.5万人，蒙古族2.2万人。辖3镇1矿区7苏木1民族乡：巴彦托海镇、伊敏镇、红花尔基镇、大雁矿区、伊敏苏木、阿尔山诺尔苏木、辉苏木、巴彦嵯岗苏木、锡尼河西苏木、锡尼很东苏木、孟根楚鲁苏木、巴彦塔拉达斡尔民族乡。旗政府驻巴彦托海镇。
2000年第五次人口普查，鄂温克族自治旗总人口146808人，其中：大雁矿区68349人，伊敏河镇28071人，巴彦托海镇24458人，红花尔基镇4137人，巴彦嵯岗苏木1655人，巴彦塔拉达斡尔民族乡2181人，锡尼河巴润苏木4489人，锡尼河准苏木2056人，伊敏苏木4492人，辉苏木2674人，阿尔山诺尔苏木1762人，孟根楚鲁苏木2484人。
2000年，全旗总人口140055人，其中汉族占60.86%，鄂温克族占6.92%，达斡尔族占10.55%，蒙古族占17.63%。辖3个镇、1个矿区、1个民族乡、7个苏木，即：巴彦托海镇、伊敏河镇、红花尔基镇、大雁矿区、巴彦塔拉达斡尔民族乡、辉苏木、北辉苏木、伊敏苏木、孟根楚鲁苏木、锡尼河东苏木、锡尼河西苏木、巴彦嵯岗苏木。
2001年12月，撤销孟根楚鲁苏木，并入锡尼河东苏木；撤销北辉苏木，并入辉苏木。调整后，全旗辖3个镇、1个矿区、5个苏木、1个民族乡：大雁矿区、伊敏河镇、巴彦托海镇、红花尔基镇、巴彦嵯岗苏木、巴彦塔拉达斡尔族乡、锡尼河巴润苏木、锡尼河准苏木、伊敏苏木、辉苏木。大雁矿务局、伊敏华能东电有限责任公司和红花尔基林业局设境内。全旗总人口43379户141069人，其中：汉族85130人，少数民族55939人（鄂温克族10011人，达斡尔族14959人，蒙古族25293人，回族1511人，满族3476人，朝鲜族228人，其他少数民族461人）。
2006年，撤销锡尼河东苏木、锡尼河西苏木，合并设立锡尼河镇；撤销红花尔基镇，并入伊敏苏木；撤销巴彦嵘岗苏木，与大雁矿区合并设立巴雁镇；将伊敏苏木的永丰嘎查并入伊敏河镇。调整后，全旗辖4个镇、1个民族乡、2个苏木：巴彦托海镇、巴雁镇、伊敏河镇、锡尼河镇、巴彦塔拉达斡尔族乡、伊敏苏木、辉苏木。全旗总面积19111平方千米。总人口143270人，其中汉族86370人，少数民族56900人（鄂温克族10329人、蒙古族26779人）。
2009年，全旗总面积19111平方千米。总人口54392户144236人，其中：汉族85911人，少数民族58325人（鄂温克族10979人、蒙古族27524人、达斡尔族14212人）。辖巴彦托海镇、巴雁镇、伊敏河镇、锡尼河镇、辉苏木、伊敏苏木、巴彦塔拉达斡尔民族乡4个镇、2个苏木、1个民族乡。旗内驻有国家煤电联营企业华能伊敏煤电有限责任公司，煤炭企业鲁能大雁矿业集团公司和呼伦贝尔市属林业企业红花尔基林业局。
2011年，撤销巴雁镇，设立大雁镇、巴彦查岗苏木；撤销锡尼河镇，设立锡尼河东苏木、锡尼河西苏木；将伊敏苏木的安园社区划出设立红花尔基镇。调整后，全旗辖4个镇、5个苏木、1个民族乡：巴彦托海镇、大雁镇、伊敏河镇、红花尔基镇、巴彦查岗苏木、锡尼河西苏木、锡尼河东苏木、巴彦塔拉达斡尔族乡、伊敏苏木、辉苏木。