2000年第五次人口普查，普兰店市常住总人口757844人，其中：丰荣街道102376人，铁西街道40648人，太平街道21360人，皮口镇55130人，城子坦镇67045人，唐家房镇14867人，大刘家镇14467人，杨树房镇28128人，双塔镇33575人，安波镇23973人，四平镇21202人，沙包镇27787人，瓦窝镇22426人，元台镇21689人，大田镇21010人，大谭镇25892人，夹河庙镇14510人，徐大屯镇19404人，莲山镇25711人，星台镇29745人，泡子乡28917人，赞子河乡22005人，墨盘乡21902人，俭汤乡14422人，同益乡20788人，乐甲乡18865人。
2001年6月4日，经省政府批复同意，撤销沙包镇、乐甲满族乡，合并设立沙包镇；撤销双塔镇、墨盘乡，合并设立双塔镇；撤销元台镇、大田镇，合并设立元台镇；撤销夹河庙镇、唐家房镇，合并设立夹河镇；撤销安波镇、俭汤乡，合并设立安波镇；撤销皮口镇、赞子河乡，合并设立皮口镇；撤销星台镇、徐大屯镇、合并设立星台镇。2001年？，设立南山街道，以普兰店经济开发区辖区为南山街道行政区域（南山街道和普兰店经济开发区合署办公，平时以普兰店经济开发区名义办公）。
2002年4月2日，省政府（辽政[2002]90号）批复同意撤销泡子乡、丰荣街道，合并设立丰荣街道。2002年6月，全市总面积2923.37平方千米，人口约82.67万人，辖4个街道、14个镇、1个乡，21个社区、179个行政村，市政府驻府前路12号。2002年11月25日，辽宁省政府（辽政[2002]295号）文件批准，撤销双塔镇，分设墨盘乡、双塔镇（即复设墨盘乡，以原并入双塔镇的墨盘乡行政区域为墨盘乡行政区域）。区划调整后，普兰店市辖4个街道（丰荣、太平、铁西、南山）、14个镇（皮口、城子坦、杨树房、元台、大刘家、大谭、夹河、星台、四平、安波、莲山、沙包、双塔、瓦窝）、2个乡（同益、墨盘）。
2006年5月15日，省政府（辽政[2006]107号）批复同意撤销沙包镇，分别设立乐甲满族乡和沙包镇。其中乐甲满族乡区域面积107平方千米，辖乐甲、对峰、沙河、庙岭、鲁凤5个村，乡政府驻地乐甲村；沙包镇区域面积157平方千米，辖沙包、吕店、孙炉、奎兴、隋沟、大盛、刘大、矫沟8个村，镇政府驻地沙包村；5月27日，乐甲满族乡挂牌成立，以原并入沙包镇的乐甲满族乡行政区域为乐甲满族乡行政区域。区划调整后，全市辖4个街道、14个镇、2个乡、1个民族乡：丰荣街道、铁西街道、太平街道、南山街道、皮口镇、城子坦镇、大刘家镇、杨树房镇、双塔镇、安波镇、四平镇、沙包镇、瓦窝镇、元台镇、大谭镇、夹河庙镇、莲山镇、星台镇、墨盘乡、同益乡、乐甲满族乡。市政府驻南山街道府前路12号。
2010年第六次人口普查，普兰店市常住总人口741230人，其中：丰荣街道118015人，铁西街道41957人，太平街道43586人，南山街道18500人，皮口镇78822人，城子坦镇60154人，大刘家镇12320人，杨树房镇29838人，双塔镇30080人，安波镇35212人，四平镇22500人，沙包镇25886人，瓦窝镇19446人，元台镇38804人，大谭镇21653人，夹河庙镇25796人，莲山镇23465人，星台镇42123人，墨盘乡18058人，同益乡18270人，乐甲满族乡16745人。
2010年5月27日，普湾新区管委会挂牌成立。陆域总面积3357.6平方千米，总人口93.2万人（2012年，下同）。其中，核心区由金州区的石河、三十里堡两个街道，瓦房店市的炮台、复州湾两个镇，普兰店市的丰荣、太平、铁西三个街道和普兰店经济开发区组成，陆域面积1045.6平方千米，海域面积210平方千米，人口41.3万人；拓展区由普兰店的15个乡镇（街道）组成，陆域面积2312平方千米，人口52万人。
2011年9月13日，省政府（辽政[2011]204号）批复同意撤销夹河镇、大谭镇、莲山镇，设立唐家房街道、大谭街道、莲山街道。2012年，将普兰店市的元台镇和瓦窝镇划归瓦房店市管辖，将瓦房店市炮台镇、复州湾镇划归普兰店市管辖（辽政[2012]169号）；并撤销炮台镇、复州湾镇，设立炮台街道、复州湾街道。【缺“金州区的石河、三十里堡两个街道划归普兰店市管辖”正式批文】
2012年12月18日，普湾新区管委会（普兰店市政府）驻地迁址炮台街道鲍鱼岛村（普湾新区普湾广场1号）。2014年6月23日，国务院（国函[2014]76号）批复同意设立大连金普新区（位于辽宁省大连市中南部，范围包括大连市金州区全部行政区域和普兰店市部分地区）。
2015年10月13日，《国务院关于同意辽宁省调整大连市部分行政区划的批复》（国函[2015]187号）：同意撤销县级普兰店市，设立大连市普兰店区，以原普兰店市的行政区域为普兰店区的行政区域，普兰店区人民政府驻南山街道府前路12号。