今普兰店市境在战国时期属燕国辽东郡。秦时属辽东郡。公元前107年，置沓氏县（治今铁西办事处）。公元190年属新置的平州辽东郡。404年（西晋末年）被高句丽割据。668年（唐代）市境为安东都护府所辖。公元919年（辽神册四年）置扶州、苏州，市境分属二州。金末分属复州、金州。元代分属金、复州万户府。明代分属金州卫、复州卫、清代分属复州、宁海县（1843年后改为金州厅）。
1898年3月沙俄强迫清政府签订《旅大租地条约》，同年5月签订《续订旅大租地条约》占据旅大。1899年8月沙皇敕令实行“关东州”官制，设貔子窝（今皮口镇）等4市5区。1905年俄日签订《朴茨茅斯和约》，沙俄将其旅大租借权转让给日本。日军占领金州，置金州军政署，下设貔子窝、普兰店、亮甲店等5个管区。1908年普兰店管区改为出张所，隶属金州民政支署，1919年关东都督府改为关东厅，1930年，金、普民政支署升格为民政署。1934年设关东局，下设关东州厅，并实行会制，今市境南部设貔子窝民政署、普兰店民政署，下设38个会。1931年，日本侵占了东北三省，将辽宁省改为奉天省，辖复县（今瓦房店市）。伪满洲国成立后，今市境北部属伪满洲国之复县。1936年伪满洲国实行街村制，被复县辖制的有复东、田家等16个村全部和复东镇的大部、天台村的小部分。
1945年9月分金县、复县部分地区设新金县（日伪统治时期设置的貔子窝、普兰店民政署所辖38个会地域），25日，新金县民主政府在貔子窝成立。1945年11月隶属安东省；1946年6月隶属辽南行政公署（1946年11月～1947年6月期间被国民党军占领），1948年8月隶属辽宁省，1949年5月隶属辽东省；1954年8月隶属辽宁省。1956年2月改隶辽阳专区。1958年11月经中共辽宁省委、省政府批复，新金县政府从貔子窝镇迁到普兰店镇，县直机关从15日起正式办公。1959年1月划归旅大市；1966年6月改归辽南专区；1968年12月隶属旅大市。1991年11月30日，国务院批复同意撤销新金县，设立普兰店市（县级）。1992年2月28日，普兰店市正式挂牌成立。2015年10月13日，国务院（国函[2015]187号）批复同意撤销县级普兰店市，设立大连市普兰店区。
1945年9月建置之初，仅设貔子窝、普兰店、城子疃3个区。1945年末又增设杨树底、登沙河、杏树屯、亮甲店、三十里堡、长山岛等区；同时将解放前原属复县的莲山、星台、骑河、复东、墨盘、双塔6个行政村（相当于解放后的区）划入新金县。1946年3月，合星台与骑河二村为星河区、新设唐家房区。同时将在苏联驻军石河驿界线以南的登沙河、亮甲店和三十里堡3个区划归金县。1946年4月，海洋岛、乌蟒岛划归庄河县。6月，增设辟朝阳、赞子河和广鹿岛3个区。同年11月，新金县共有貔子窝、普兰店、城子疃、复东、双塔、莲山、星河、杨树底、唐家房、朝阳、赞子河、长山岛和广鹿岛共13个区。
1946年11月26日，国民党军占据新金县的大部分地区，将日伪时属复县的行政村仍归复县，在原日占“关东州”貔子窝民政署辖地（除长山列岛）和普兰店民政署辖地（除在苏军岗里部分），建立起“金县”，并重划乡、镇，乡下设保、甲。1947年2月，将长山列岛之长山区和广鹿区划归金县。
1947年6月6日新金县第二次解放当时，辖11个区。7月，复县所辖的白山、孤山两区划归新金县；将星河区改为星台区，同时增设骑河区。同年秋增设长山寺、四平、沙河、郑窑和墨盘5个区，共计19个区。1948年1月，增设夹心子区。同年3月，撤销貔子窝、普兰店、城子疃、夹心子4个行政区，新设碧流河、太平两个行政区和貔子窝、普兰店、城子疃3个镇。同年12月8日，万福县建制撤销后，其所辖之安波、俭汤、岔沟3个区划归新金县。至此，全县共设21区、3镇，下辖305个行政村、21街。
新中国成立后，仍保持1945年设置时的面积2769.9平方千米。1949年10月人口48.7万人。1949年12月7日，经辽东省政府批准，将21个行政区、3个镇，合并为17个行政区、1个镇，原貔子窝、城子疃两个镇改为区，撤销碧流河、郑家窑、长山寺、骑河、墨盘、白山等6个行政区。
1950年8月15日，根据辽东省政府令，将17个区按数序排列：貔子窝区为第1区；赞子河区为第2区;城子疃区为第3区；复东区为第4区；星台区为第5区；双塔区为第6区；俭汤区为第7区；安波区为第8区；岔沟区为第9区；四平区为第10区；孤山区为第11区；莲山区为第12区；沙河区为第13区；朝阳区为第14区；太平区为第15区；唐家房区为第16区；杨树房区第17区；普兰店镇不变。