南票之名始于清代，因得到清朝皇帝御笔准许开采煤矿的“龙票”而得名，落在朝阳以南的称为南票。1962年设南票镇。1983年1月1日（1982年8月13日国务院批准；1982年9月9日辽宁省政府批准）设立南票区，属锦州市，以锦西县的南票镇和沙锅屯公社为南票区行政区域。
1990年（1989年6月12日国务院批准）由锦州市划入锦西市（1994年更名为葫芦岛市），同时将原锦西市的暖池塘镇、缸窑岭镇、黄土坎乡划归南票区。
1996年，南票区面积512平方千米，人口约14.6万人。辖7个街道、2个镇、3个乡：黄甲屯街道、邱皮沟街道、小凌河街道、赵家屯街道、苇子沟街道、沙锅屯街道、三家子街道、暖池塘镇、缸窑岭镇、沙锅屯乡、兰甲屯乡、黄土坎乡。区政府驻兰甲屯。
2000年第五次人口普查，南票区常住总人口136254人，其中：黄甲屯街道16238人，沙锅屯街道3786人，苇子沟街道3117人，三家子街道6127人，赵家屯街道8875人，邱皮沟街道7296人，小凌河街道3523人，暖池塘镇21300人，缸窑岭镇19744人，兰甲屯乡15354人，沙锅屯乡15642人，黄土坎乡15252人。
2002年3月4日，省政府（辽政[2002]62号）批复同意：撤销兰甲乡，将其原所辖行政区域划入黄甲街道办事处，并将黄甲街道办事处更名为九龙街道办事处。
2002年6月，南票区辖7个街道、2个镇、2个乡，37个社区、83个行政村，面积511.60平方千米，人口约13.62万人，区政府驻黄甲屯。
2010年第六次人口普查，南票区常住总人口120969人，其中：赵家屯街道6343人，沙锅屯街道4663人，邱皮沟街道4700人，苇子沟街道2508人，三家子街道5792人，小凌河街道2214人，九龙街道30392人，缸窑岭镇18526人，暖池塘镇19310人，沙锅屯乡13830人，黄土坎乡12476人，乌金塘水库215人。
2011年，将连山区高桥镇整建制划归南票区（辽政[2011]205号）。2012年，将连山区台集屯镇、金星镇划入南票区（辽政[2012]19号）；将连山区虹螺岘镇、张相公屯乡划入南票区（辽政[2012]23号）；将连山区大兴乡划入南票区。
2013年11月12日，省政府（辽政[2013]226号）批复同意：将高桥农场北至南票区高桥镇万家屯村，南至打渔山泵业产业园区和谐路，东至王三线公路、毗邻季家屯村，西至沈山铁路高桥段的3.5平方公里区域，划归连山区管辖；将打渔山南票新城东至解放路，西至渔山路，南临滨海大道，北至建业街的1平方公里区域，划归南票区管辖。
2014年，设立龙飞街道、龙腾街道、龙祥街道（葫政[2014]121号）。至此，全区辖10个街道、6个镇、4个乡：赵家屯街道、沙锅屯街道、邱皮沟街道、苇子沟街道、三家子街道、小凌河街道、九龙街道、龙飞街道、龙腾街道、龙祥街道、缸窑岭镇、暖池塘镇、高桥镇、台集屯镇、虹螺岘镇、金星镇、沙锅屯乡、黄土坎乡、大兴乡、张相公屯乡。区政府驻九龙街道龙首路42号。