秦始皇三十三年（公元前214年），置南壄县，隶九江郡，为赣南建置政权之始。汉高祖六年（公元前201年），置豫章郡，治南昌，领18县，其中赣南3县隶之：南壄县（约辖今南康、大余、上犹、崇义、信丰、龙南、定南、全南等地）、赣县（约辖今章贡区、赣县、兴国等地）、雩都县（约辖今于都、宁都、石城、瑞金、会昌、安远、寻乌等地）。西汉末年，改豫章郡为九江郡。东汉建武元年（公元25年），九江郡复名豫章郡，南壄改为南野，赣南3县仍隶之。兴平元年（194年），分豫章郡置庐陵郡，赣南3县隶庐陵郡。
三国东吴嘉禾五年（236年）析庐陵郡置庐陵南部都尉，治雩都，属扬州，领雩都、赣县、平阳（由赣县分出，即今兴国年）、阳都、揭阳（析雩都白鹿营地置阳都；析阳都陂阳地置陂阳县，随后改为揭阳年）、南安（由南野分出，约辖今南康、信丰、龙南、定南、全南等地年）、南野（约辖今大余、上犹、崇义等地年）七县。晋太康元年（280年），改南安为南康，改阳都为宁都，改平阳为平固。
西晋太康三年罢庐陵南部都尉，置南康郡，治雩都，将南野并入南康，领6县。五年（284年），改揭阳为陂阳。十年（289年），赣县移县治于葛姥城（今章贡区虎岗一带年）。元康元年（291年），南康郡改属江州都督府。永和五年（349年），郡治从雩都迁至赣县（章、贡两水间，今章贡区年）。南北朝梁大宝元年（550年），南康郡地大余改属广东东衡州始兴郡。陈太建十三年（581年），大余改隶广东东衡州安远郡。
隋开皇九年（589年），改南康郡为虔州，隶洪州总管府。平固并入赣县、南野并入南康、虔化并入宁都。十三年（593年），陂阳县设石城场，并入宁都。虔州领4县：赣县、雩都、南康、宁都。
唐置虔州，贞观元年（627年）属江南道。永淳元年（682年），析南康东南地复置南安县（约辖今信丰、龙南、定南、全南等地年），虔州领5县。神龙元年（705年），复置大余县，虔州领6县。天宝元年（742年），南安改名信丰县，并分出原南安地置百丈泉，后改虔南镇。开元二十一年属江南西道。贞元四年（788年），分出雩都三乡和信丰一里复置安远县，虔州领7县。天祐元年（904年），从雩都县分出象湖镇置瑞金监。
后梁开平三年（909年），虔州属梁。四年（910年），以虔、韶2州置百胜军；南唐昇元元年（937年），改百胜军为昭信军，虔州属之。乾化元年（911年），析南康县地置上犹场。保大十年（952年），改上犹场为上犹县，翌年改瑞金监为瑞金县，虔南场为龙南县，石城场为石城县。至此，虔州领11县：赣县、雩都、信丰、南康、大余、虔化、安远、上犹、瑞金、龙南、石城。
宋开宝八年（975年），改昭信军为军州。大平兴国元年（976年），改军州复为虔州，隶江南西路；七年（982年），从赣县分出潋江镇7乡及庐陵泰和部分辖地置兴国县，从雩都分出县东南6乡于九州镇置会昌县。虔州领13县。淳化元年（990年），以虔州原辖南康、大余、上犹3县另置南安军，治大余。虔州领10县，隶江南西路。宣和三年（1121年），龙南县改名为虔南。绍兴二十三年（1153年），校书郎董德元以“虔”字为虎头，虔州号“虎头城”，非佳名，奏请改名，诏改虔州为赣州（取章、贡二水合流之义年），赣州名始此。同时，虔化县改名为宁都，虔南县复名为龙南。
元至元十三年（1276年），改江南西路为江西行中书省，赣州、南安军隶江西行省。至元十四年（1277年），赣州、南安军分别改为赣州路总管府、南安路总管府。隶属与领县如旧。吴二年（1365，元至正二十五年），赣州、南安两路改为府。明洪武十八年（1385年），江西分为5道，赣州、南安2府均属岭北道。成化十三年（1477年），设分巡岭北道于赣州，赣州、南安2府属之。弘治七年（1494年），置南赣巡抚都察院于赣州，称虔院。正德十一年（1516年），置巡抚南赣汀韶等处地方提督军务，辖江西的南安、赣州，广东的韶州、南雄州，湖南的郴州和福建的汀州等州府。正德十二年（1517年），从上犹、南康、大余3县划出部分辖地置崇义县，属南安府，至此，南安府领4县：大余、南康、上犹、崇义。嘉靖三十六年（1557年），增设分守岭北、岭东、岭南、漳南4道，统于虔院。岭北巡、守两道治赣州，赣州、南安2府隶之。隆庆三年（1569年），从安远、信丰、龙南3县划出部分辖地置定南县，隶赣州府。万历四年（1576年），以安远县原辖寻乌等15堡另置长宁县，隶赣州府。至此，赣州府领12县，南安府领4县。
清顺治十年（1653年）至康熙八年（1669年），先后撤销南赣守抚和巡、守两道。康熙十年（1671年），置分巡赣南道，辖赣州府、南安府。雍正九年（1731年），改分巡赣南道为分巡吉南赣道，增辖吉安府。乾隆十九年（1754年），升宁都县为宁都直隶州，辖瑞金、石城2县，为赣南分设赣州府、南安府、宁都直隶州3个政区之始。同年，改分巡吉南赣道为吉南赣宁兵备道，增辖宁都直隶州。
民国元年（1912年）废府（州年）、厅设县，县直隶省。民国3年（1914年）江西设浔阳、豫章、庐陵、赣南4道。赣南道，治赣县，领17县：赣县、雩都、信丰、兴国、会昌、安远、长宁、龙南、全南、定南、宁都、瑞金、石城、南康、大余、上犹、崇义。民国15年（1926年），废赣南道，县直隶省。民国21年（1932年）全省划为13个行政区，赣南各县分属第九、十一、十二、十三行政区：兴国县归第九行政区；第十一行政区（后改称赣南行政长官公署年）设赣州，辖赣县、南康、信丰、上犹、崇义、大余6县；第十二行政区设宁都，辖宁都、广昌、石城、瑞金、雩都、会昌6县；第十三行政区设龙南，辖龙南、定南、全南、安远、寻乌5县。民国22年（1933年），第十一、十三2个行政区合并，改名赣南政务专员公署，先设大余，后迁赣州，领11县。民国24年（1935年），全省改划为8个行政区，赣南各县分属江西省第四、八行政区：第四行政区设赣州，辖赣县、南康、信丰、大余、上犹、崇义、龙南、定南、全南、安远、寻乌11县；第八行政区设宁都，辖宁都、广昌、石城、瑞金、会昌、雩都、兴国7县。
民国18年至23年（1929年至1934年）赣州大片土地成为中央革命根据地，赣南各地先后成立苏维埃政府，分别隶属江西、湘赣、粤赣、赣南省苏维埃政府。并于1934年8月在瑞金成立了中华苏维埃共和国临时中央政府。