南岔一带，原属汤原县管辖，1945年12月人民民主政府设置南岔区，1950年改为第五区。1952年10月，划归伊春县管辖，翌年春设置南岔镇。1957年7月，国务院批准伊春撤县设市，同年11月20日，省人民委员会批准，撤销南岔镇，设立伊春市南岔区，同时于南部浩良河地区设立浩良河区。
1946年8月，合江省林务局在南岔设林务分局，1949年9月与汤原林务分局合并为汤原林务局。1951年7月，撤销鹤岗林务分局，大部分人员迁至南岔，组建南岔林务分局，1958年4月改称南岔林业局。1964年10月，南岔区与南岔林业局实行“政企合一”管理体制。1969年10月13日，撤销浩良河区，并入南岔区。
1992年末，南岔区位于伊春市境南部，汤旺河下游，东邻汤原县，南接依兰县，西界带岭区，北与金山屯区毗连。绥佳线、南乌线铁路于此交会，南岔站为一等站。全区总面积3088.4平方千米，其中建成区面积25平方千米，是全市面积最大的一个区，也是绥佳铁路线上规模较大的一个工业区。总人口14.86万人，其中非农业人口12.6万人满、回、蒙古等少数民族人口约占1.4%。辖东升、建国、联合、民主、梧桐5个街道和2镇、1乡。区政府和南岔林业局驻地南岔，距市区中心71千米。（以上摘自《黑龙江省志·地名录》，有改动）
2000年第五次人口普查，南岔区总人口140846人，其中：联合街道14837人，建国街道18618人，民主街道14153人，西水街道14325人，东升街道17211人，梧桐街道2965人，松青街道3837人，柳树街道1019人，三岔河街道842人，四合营街道761人，亮子河街道812人，石头河街道966人，翠岗街道370人，岩石街道998人，奋斗街道407人，桦阳街道1725人，浩良河所街道1126人，太平街道955人，南岔所街道742人，威岭街道1102人，大磊街道702人，浩良河镇25826人，晨明镇11150人，迎春乡5397人。