2003年3月6日，国务院（国函[2003]37号）批准同意调整贵港市港北区行政区划，设立贵港市覃塘区，将贵港市港北区的覃塘镇、黄练镇、东龙镇、三里镇、五里镇、石卡镇、蒙公乡、山北乡、古樟乡、振南乡、大岭乡划归覃塘区管辖。区人民政府驻覃塘镇覃塘大道。
2003年，覃塘区辖6个镇、5个乡：覃塘镇、东龙镇、三里镇、黄练镇、石卡镇、五里镇、山北乡、古樟乡、振南乡、蒙公乡、大岭乡。
2005年7月19日，广西壮族自治区政府（桂政函[2005]206号）同意撤销覃塘区振南乡，整建制并入该区古樟乡，调整后的古樟乡更名为樟木乡，樟木乡政府驻原古樟乡樟木村。
附：2003年覃塘区行政区划（根据当年广西行政区划代码整理）
100 覃塘镇 辖覃塘社区；珠砂、六务、谷罗、龙岭、龙凤、姚山、大郭、黄鹤、覃南、周村、杨志、回龙、甘碑、拥兴14个行政村。
101 东龙镇 辖石龙社区；石龙、罗马、农昌、阮寺、凤凰、义合、蓝山、闭村、大同、京龙、京榜、三六、长岭、高龙、龙扶15个行政村。
102 三里镇 辖三里社区；甘道、龙田、九岸、双凤、大零、大周、隆兴、水仙、吉塘、石社10个行政村。
103 黄练镇 辖黄练社区；镇水、山谢、大黄、新朱、岭岑、大董、平寨、姚岭、莫村、新何、新潭、潘陈、葵新、居仕、张团15个行政村。
104 石卡镇 辖石卡社区；江南、大庆、西山、方竹、大岩、陆村、樟竹、白沙、翰平、福龙、万塘、新旺、鹤心、凤思、翰芦、村面、都蕴、泥湾18个行政村。
105 五里镇 辖五里社区；榕木、林村、垌心、云表、龙贵、大成、东流7个行政村。
200 山北乡 辖山北、中秋、万寿、双岩、二龙、柳乌、横罗、保和、石马、松英、煌里11个行政村。
201 古樟乡 辖樟木街居委会；樟木、黄龙、六旺、黄道、显滕、川山、寺江、元金、大旗、李塘、沙村、良古、中唐、那柳、颜塘、荣盏16个行政村。
202 振南乡 辖中周、罗柴、邓保、五龙、中团、沙水、卢村、凌动8个行政村。
203 蒙公乡 辖蒙公、岭庆、占蒙、平龙、定布、姚见、英峨、黄岭、新岭、廖瑞、高占、古山、凌寺、双龙14个行政村。
204 大岭乡 辖大岭、村心、新井、新济、古平、贵宁、江兴、金沙、龙马、互合10个行政村。