汉置观阳县，隋初废入湘源县，旋后复置改名灌阳县，唐再入湘源县，五代入清湘县，宋复置灌阳县。
1996年，灌阳县面积1863平方千米，人口约26.3万人。辖3个镇、7个乡（其中2个民族乡）：灌阳镇、黄关镇、文市镇、洞井瑶族乡、观音阁乡、西山瑶族乡、新街乡、红旗乡、新圩乡、水车乡。县政府驻灌阳镇。
1999年3月，撤销红旗乡并入灌阳镇。调整后，全县辖3个镇、6个乡（其中2个民族乡）：灌阳镇、黄关镇、文市镇、洞井瑶族乡、观音阁乡、西山瑶族乡、新街乡、新圩乡、水车乡。县政府驻灌阳镇。
2000年第五次人口普查，灌阳县总人口231288人。其中：灌阳镇57268人，黄关镇38610人，文市镇30014人，洞井瑶族乡7917人，观音阁乡7711人，西山瑶族乡10644人，新街乡34562人，新圩乡19283人，水车乡25279人。
2003年灌阳县行政区划（根据当年广西行政区划代码整理）
100 灌阳镇 辖城北、城中、城南3个社区居委会；城关、莫家、胡家、鹤龙、上王、秀风、长坪、大仁、福星、文化、三联、仁江、仁柜、车田、仁狮、仁义、雷坪、仁合、鱼塘、马头、翻身、大源、徐源、苏东、仁渡、排埠江26个村委会。
101 黄关镇 辖黄关、中秀、唐官、李官、东阳、大竹山、陡水、兴秀、联德、正江、龙吟、大倚、猫儿石、商家、顺溪15个村委会。
102 文市镇 辖文市、大湾、西就、吉田、吉头、瑶上、月岭、玉溪、清塘、桂岩、勒塘、集全、北流、陈家坪、同仁、王道、昭仪、会湘、马莲、达溪、联合、月岭、瑶山23个村委会。
200 洞井瑶族乡 辖洞井、桂平岩、椅山、太和、石家寨、保良、野猪殿、大竹源、小河江9个村委会。
201 观音阁乡 辖文明、桃花、自振、大井塘、立强、盘江6个村委会。
202 西山瑶族乡 辖李家、罗家、鹰嘴、盐塘、小源、南江、茶源、北江、下涧、大坪10个村委会。
203 新街乡 辖新街、永富、马山、三树、车头、戈洞、龙炼、龙云、烈溪、邓家、龙中、石风、青箱、江口、虎坊、坪涧、娘北、飞熊、上甫、叶官、三江21个村委会。
204 新圩乡 辖新圩、桂阳、平田、新卫、光明、和睦、国豪、共耕、龙塘、潮立、龙桥、小龙、大龙、解放、合力、洪水箐16个村委会。
205 水车乡 辖水车、修睦、璃碧、伍家湾、官庄、合成、下泡、上泡、三皇洞、德里、大营、东流、江塘、同德14个村委会。