惠来县古为百越之地。秦汉为南海郡博罗、揭阳辖地。晋以后至明代中期均为潮阳、海丰辖地。明嘉靖三年（1524），始析潮阳县隆井都一半和大坭、惠来、酉头3都及海丰县的龙溪都合置惠来县，因县治在惠来都，故名。属潮州府至清末。
嘉靖四年（1525）建城，得名惠城，因其地处葵岭东南，故又称葵阳。嘉靖三十二年（1553），又割入靖海千户所。民国时期先后属广东都督府、巡按使潮循道、东江行政委员公署、东区绥靖委员公署、广东省第五、第七区行政督察专员公署。
1949年5月20日惠来全境解放，8月成立惠来县人民政府。先后隶属潮梅人民行政公署、潮汕临时专员公署、潮汕区行政督察专员公署、潮汕专员公署、粤东行政公署、汕头专区。1958年12月10日撤县分并于普宁、潮阳县。1961年3月恢复惠来县，属汕头地区。1983年隶属汕头市，1992年归属揭阳市。
1987年，惠来县总人口74.12万人。辖14个镇、3个乡、4个农林场，288个村委会，27个居委会，553个自然村。
1996年，惠来县面积1253平方千米，人口约87万人。辖14个镇、3个乡：惠城镇、神泉镇、华湖镇、靖海镇、前詹镇、周田镇、仙庵镇、隆江镇、溪西镇、葵潭镇、鳌江镇、岐石镇、东港镇、河林乡、南海乡、青山乡。县政府驻惠城镇。
1999年，惠来县辖14镇3乡（惠城镇、华湖镇、仙庵镇、靖海镇、周田镇、前詹镇、神泉镇、东陇镇、岐石镇、隆江镇、溪西镇、鳌江镇、东港镇、葵潭镇、南海乡、青山乡、河林乡）；大南山华侨管理区辖3办事处（桃园办事处、龙湖办事处、岭门办事处）。
2000年第五次人口普查，惠来县常住总人口961658人，其中：惠城镇115033人、华湖镇56075人、仙庵镇72274人、靖海镇64137人、周田镇65582人、前詹镇43938人、神泉镇70110人、东陇镇73523人、岐石镇48583人、隆江镇99244人、溪西镇45636人、鳌江镇38461人、东港镇25384人、葵潭镇75063人、南海乡13965人、青山乡10494人、河林乡17255人、东埔农场9654人、葵潭农场4325人、大南山华侨管理区12303人、青坑林场619人。
2003年，撤销青山乡，将其行政区域并入葵潭镇和隆江镇；其管辖的螃蟹、青坑、圆墩3个村委会划归葵潭镇，葵潭镇政府驻地不变；其管辖的头寮、尾寮2个村委会划归隆江镇，隆江镇政府驻地不变。撤销河林乡，将其行政区域并入惠城镇，调整后，惠城镇辖原惠城镇和河林乡的行政区域范围，惠城镇政府驻地不变。2003年5月撤销南海乡，林沟、赤一、赤二等村划归隆江镇管辖，和双、双湖、朱埔等村划归岐石镇，埔洋、山陇等村划归溪西镇。
至此，惠来县辖惠城、华湖、仙庵、靖海、周田、前詹、 神泉、东陇、岐石、隆江、溪西、鳌江、东港、葵潭14个镇。
2009年末，惠来县面积1253平方千米，辖14个镇，39个社区、286个行政村。县政府驻惠城镇南门大街1号。
2010年第六次人口普查，惠来县常住总人口1097596人，其中：惠城镇150974人，华湖镇58098人，仙庵镇73033人，靖海镇70991人，周田镇63621人，前詹镇44963人，神泉镇80149人，东陇镇81070人，岐石镇63462人，隆江镇140744人，溪西镇65033人，鳌江镇48039人，东港镇33117人，葵潭镇95717人，东埔农场9699人，揭阳市大南山华侨管理区14375人，葵潭农场3420人，青坑林场1091人。
2012年末，惠来县面积1253平方千米。户籍人口132.98万人，常住人口109.66万人。辖14个镇。