1991年11月，以原汕头经济特区龙湖片区为主体，划入原郊区下蓬镇，始设龙湖区。1996年，面积46.3平方千米，常住人口20多万人。辖4个街道、1个镇：新津街道、珠池街道、龙湖街道、金霞街道、下蓬镇。2000年，龙湖区辖8个街道。
2000年第五次人口普查，龙湖区常住总人口255888人，其中：金霞街道29233人，龙湖街道26909人，珠池街道56965人，新滓街道64109人，鸥汀街道29934人，龙津街道20212人，渔洲街道14749人，龙祥街道13777人。2002年，龙湖区辖珠泡、龙湖、金霞、新津、龙津、移洲、龙祥、欧汀8个街道，共有5个村委会、64个居委会。
2003年1月29日，国务院批准（国函[2003]11号）：将原澄海市的外砂、新溪2个镇、原金园区高新技术开发区东片区域（即东起天山北路，西至华山北路，南起汕头经济特区北界线，北至科技北三街向南转向科技西路再转向科技北二街）划归龙湖区管辖。4月1日，完成了原澄海市外砂镇、新溪镇行政管辖权的移交工作。
2003年，龙湖区辖珠池、金霞、新津、龙祥、鸥汀5个街道和新溪、外砂2个镇，共有75个居委会、32个村委会。全区总人口90961户337406人，金霞街道11044户40841人；珠池街道15210户50579人；新津街道12794户39762人；鸥汀街道13230户41849人；龙祥街道7275户23986人；外砂镇18140户79467人；新溪镇13268户60922人。
2008年末，全区面积100.7平方千米，户籍总人口379990人。2009年末，龙湖区辖5个街道、2个镇，78个居委会、32个行政村。区政府驻大北山路1号。
2010年第六次人口普查，龙湖区常住总人口536356人，其中：金霞街道69826人，珠池街道136289人，新津街道90471人，鸥汀街道45884人，龙祥街道41795人，外砂镇86659人，新溪镇65432人。2012年末，全区面积103.13平方千米，户籍人口40.99万人，常住人口54万人。