1984年1月27日，国务院批准：设立营口市鲅鱼圈区，以盖县鲅鱼圈公社为其行政区域。1988年3月，辽宁省政府决定在此兴建营口出口加工区；1990年8月更名为营口新经济区。
1992年10月，国务院批准在鲅鱼圈区设立国家级经济技术开发区。1998年底（一说1993年3月），营口经济技术开发区管委会、鲅鱼圈区政府合署办公，管委会作为市政府的派出机构，对开发区（鲅鱼圈区）的政务工作实行全面领导，区政府主要为开发建设和港口发展提供社会保障服务。
1996年，鲅鱼圈区面积65平方千米，人口约9.2万人。辖4个街道：海星街道、红海街道、海东街道、望海街道。区政府驻海星街道。
2000年第五次人口普查，鲅鱼圈区常住总人口134576人，其中：海星街道86280人，红海街道16252人，望海街道7226人，海东街道24818人。
2002年6月，全区辖4个街道，12个社区、15个行政村，面积66.4平方千米 ，人口约11.79万人。
2004年1月8日，国务院（国函[2004]2号）批准同意将县级盖州市的熊岳镇、芦屯镇、红旗镇划归营口市鲅鱼圈区管辖（注：辽宁省政府辽政[2004]30号文件批复；实际已于2003年调整）。调整前：鲅鱼圈区面积66平方千米，人口12万人（面积人口数据根据简册2004）。调整后，全区面积268平方千米，辖4个街道、3个镇。
2008年12月，区政府（管委会）驻地由海星街道钱塘江路15号迁至红海街道日月大道【2004年起已不在原址办公，新址于2006年开始建设】。
2010年第六次人口普查，鲅鱼圈区常住总人口431087人，其中：红海街道51661人，海星街道136641人，望海街道8146人，海东街道55110人，熊岳镇97477人，芦屯镇58062人，红旗满族镇23990人。