截至2007年4月4日，全区共有8个街道、7个镇：苏苑街道、长桥街道、龙西街道、城南街道、越溪街道、横泾街道、郭巷街道、香山街道、甪直镇、光福镇、临湖镇、木渎镇、西山镇、东山镇、胥口镇。
　　2007年，江苏省政府批复，同意吴中区：（1）将胥口镇的善人桥居委会及藏东、藏中、藏北、藏西等4个村委会划归木渎镇管辖，并将临湖镇的马舍村委会划归胥口镇管辖。行政区划调整后，木渎镇行政区域面积70.3平方千米，人口8万人，辖8个居委会、10个村委会；胥口镇行政区域面积38.2平方千米，人口2.7万人，辖1个居委会、6个村委会；临湖镇行政区域面积54.3平方千米，人口4.2万人，辖2个居委会、12个村委会。（2）将光福镇的舟山村委会划归香山街道办事处管理。行政区划调整后，光福镇行政区域面积63平方千米，人口4.4万人，辖1个居委会、7个村委会；香山街道办事处面积17.3平方千米，人口1.7万人，管理3个居委会、5个村委会。（苏府复[2007]64号）